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Updated: Feb 26, 2026

Author Spotlight: Efficient Detection of Immune Cell-Infiltration in Cancer Tissues Using Fluorescent Immunohistochemistry
Published on: January 26, 2024
iCLAP: un método innovador para la codetección integrable de antígenos de baja abundancia con inmunotinción de alto
Fan Wu1,2, Shuyuan Zheng1, Yani Chen1
1Department of Chemical and Biomolecular Engineering, The Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, USA.
Insights
La nueva tecnología de codetección integrable de proteínas de baja abundancia (iCLAP) permite la detección sensible de proteínas de alto plex en tejidos fijados con formalina e incrustados en parafina. Este método permite estudios proteómicos espaciales de proteínas de baja abundancia en muestras biológicas complejas.
Área de la Ciencia:
- Biotecnología
- Biología Molecular
- Patología
Sus antecedentes:
- La imagen proteica multiplexada es crucial para el análisis espacial de tejidos complejos.
- La detección de proteínas de baja abundancia en tejidos fijados con formalina e incrustados en parafina (FFPE) es un desafío con los métodos actuales de alto plex.
- Muchos reguladores importantes, como los factores de transcripción y los marcadores de senescencia, son difíciles de estudiar in situ.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar un método sensible y altamente multiplexado para la detección de proteínas en tejidos FFPE.
- Permitir el estudio de proteínas de baja abundancia in situ dentro de especímenes FFPE.
- Ampliar las capacidades del análisis proteómico espacial en tejidos FFPE.
Principales métodos:
- Se introdujo la codetección integrable de proteínas de baja abundancia (iCLAP).
- iCLAP combina la amplificación de señales iterativa con la inactivación eficiente de fluoróforos.
- Permitió la tinción repetida en la misma sección de tejido FFPE para más de 40 marcadores.
Principales resultados:
- Se demostró la detección sensible y altamente multiplexada de proteínas en tejidos FFPE.
- Se perfilaron con éxito más de 40 marcadores en una sola sección de tejido FFPE.
- Se revelaron patrones de proteínas espacialmente distintos asociados con la senescencia en tejidos pancreáticos humanos.
Conclusiones:
- iCLAP mejora significativamente la sensibilidad de la detección de proteínas en tejidos FFPE.
- El método facilita estudios proteómicos espaciales de alta dimensionalidad de procesos biológicos complejos.
- iCLAP amplía la utilidad analítica de los especímenes FFPE para el análisis de proteínas in situ.
Abstract:
Multiplexed protein imaging enables spatial analysis of complex tissues, but detecting proteins expressed at low levels remains challenging, particularly in widely available formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) specimens. Many biologically important regulators-including senescence markers, transcription factors, and secreted proteins-are therefore difficult to study in situ using existing high-plex methods. Here we show that integrable Co-detection of Low-Abundant Proteins (iCLAP) enables sensitive and highly multiplexed protein detection within the same FFPE tissue section. iCLAP combines iterative signal amplification with efficient fluorophore inactivation, enabling repeated staining of the same tissue section and seamless integration with established multiplex imaging platforms to achieve profiling of more than 40 markers. Application of iCLAP to human pancreatic tissues revealed spatially distinct senescence-associated protein patterns across tissue compartments. Together, iCLAP expands the analytical capabilities of FFPE tissues, enabling high-sensitivity, high-dimensional spatial proteomic studies of complex biological processes.
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