一个多斑点乳腺癌组织学整体幻灯片图像数据集,来自常规诊断

科学领域:

• 病理学 病理学 病理学
• 计算生物学 计算生物学
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• FFPE乳腺癌组织部分的血氧氨酸和氨酸 (H&E) 和免疫组织化学 (IHC) 染色对于病理评估至关重要.
• 在诊断中,IHC被广泛用于生物标志物状态 (ER,PGR,HER2,KI67).
• 计算病理学显示了使用整个幻灯片图像 (WSIs) 的生物标志物评估的希望.

研究的目的:

• 解决乳腺癌研究中计算病理学公共数据的稀缺问题.
• 从原发性乳腺癌样本中创建匹配的H&E和IHC WSIs最大的公开可用的数据集.

主要方法:

• 收集了女性原发性乳腺癌患者手术切除的FFPE组织切片.
• 有H&E和各种IHC标记的染色部分.
• 获取所有染色部分的整个幻灯片图像 (WSI).
• 匹配了来自同一瘤组织的H&E和IHC染色物的WSIs.

主要成果:

• 发布了迄今为止最大的公共数据集,其中包含匹配的H&E和IHC WSIs.
• 该数据集包括4,212名来自1,153名原发性乳腺癌患者的WSI.
• 这一数据集代表了开发和验证计算病理学算法的重要资源.

结论:

• 新发布的数据集显著提高了乳腺癌研究高质量,匹配的成像数据的可用性.
• 促进了先进的计算工具的开发,以便更准确,更有效地分析生物标志物.
• 旨在通过改进的图像分析技术,加速乳腺癌精准医学的进展.