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CRISPR and crRNAs02:53

CRISPR and crRNAs

Bacteria and archaea are susceptible to viral infections just like eukaryotes; therefore, they have developed a unique adaptive immune system to protect themselves. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated proteins (CRISPR-Cas) are present in more than 45% of known bacteria and 90% of known archaea.
The CRISPR-Cas system stores a copy of foreign DNA in the host genome and uses it to identify the foreign DNA upon reinfection. CRISPR-Cas has three different...

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T M Lowe1, S R Eddy

  • 1Department of Genetics, Washington University School of Medicine, 4566 Scott Avenue, St. Louis, MO 63110, USA. lowe@genetics.wustl.edu

Science (New York, N.Y.)
|February 19, 1999
PubMed
Resumen

Los investigadores identificaron 22 nuevos pequeños ARN nucleolares guía de metilación (snoRNAs) en la levadura utilizando métodos computacionales. Estos snoRNAs son esenciales para modificar el ARN ribosomal, crucial para la síntesis de proteínas.

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Área de la Ciencia:

  • Biología Molecular Biología Molecular
  • La genómica es la genómica.
  • ARN Biología Biología ARN

Sus antecedentes:

  • Los pequeños ARN nucleolares (snoRNAs) son críticos para la 2'-O-metilación del ARN ribosómico eucariótico (ARNr).
  • Numerosos genes de snoRNA responsables de guiar la metilación del rRNA en Saccharomyces cerevisiae permanecieron sin descubrir a pesar de un genoma completamente secuenciado.

Objetivo del estudio:

  • Para identificar computacionalmente snoRNAs guía de metilación previamente no identificados en el genoma de la levadura.
  • Para validar experimentalmente la función de los snoRNAs recién identificados en la metilación del rRNA.

Principales métodos:

  • Utilizó técnicas de modelado probabilístico, similares a las del reconocimiento del habla y la lingüística computacional, para el cribado de todo el genoma.
  • Se realizó la alteración genética y la caracterización experimental para confirmar la función de los snoRNAs predichos.

Principales resultados:

  • Identificó 22 nuevos snoRNAs guía de metilación, designados de snR50 a snR71, dentro del genoma de la levadura.
  • La validación experimental confirmó la función guía de metilación de estos snoRNAs identificados.
  • Se ha asignado con éxito 51 de los 55 sitios de metilación de la ribosa en el ARNr de levadura a 41 distintos snoARN guía.

Conclusiones:

  • El estudio amplía significativamente el repertorio conocido de snoRNAs guía en Saccharomyces cerevisiae.
  • Los hallazgos proporcionan una comprensión más completa de los mecanismos que rigen la metilación de la ribosa de rRNA en eucariotas.