Identificación de un regulador de coordenadas de las interleucinas 4, 13 y 5 mediante comparaciones de secuencias...

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología Molecular Biología Molecular
• La bioinformática es la bioinformática.

Sus antecedentes:

• Descubrir elementos regulatorios de largo alcance es experimentalmente desafiante.
• Las secuencias conservadas entre especies pueden indicar importancia funcional.

Objetivo del estudio:

• Para identificar elementos no codificantes conservados entre los genomas de humanos y ratones.
• Para caracterizar la función de estos elementos.

Principales métodos:

• Análisis comparativo de genómica de 1 megabase de secuencias ortólogas de humanos y ratones.
• Identificación de los elementos no codificantes conservados (>70% de identidad sobre >=100 bp).
• Caracterización funcional utilizando cromosomas artificiales de levadura en ratones transgénicos.

Principales resultados:

• Se identificaron noventa elementos no codificantes conservados.
• Aproximadamente el 70% de los elementos analizados mostraron conservación cruzada entre mamíferos.
• El elemento identificado más grande coordina tres genes inmunes (interleucina-4, -13, y -5) en más de 120 kb.

Conclusiones:

• La comparación de secuencias entre especies es una estrategia efectiva para descubrir elementos regulatorios a largo plazo.
• Se descubrió un nuevo elemento regulador de largo alcance que controla los genes inmunes clave.