Amplificación por PCR del patógeno de la hambruna de la papa irlandesa a partir de especímenes históricos

Área de la Ciencia:

• Fitopatología Fitopatología.
• Filogenética molecular Filogenética molecular
• Botánica histórica de las plantas.

Sus antecedentes:

• El brote tardío, causado por Phytophthora infestans, devastó los cultivos de patata, desencadenando notablemente la hambruna de patata irlandesa de 1845.
• Antes de la década de 1980, las poblaciones de Phytophthora infestans eran principalmente del genotipo US-1 (haplotipo de ADN mitocondrial Ib), con reproducción sexual confinada a México.

Objetivo del estudio:

• Para confirmar la identidad de P. infestans en muestras históricas de herbario de la década de 1840.
• Reevaluar las teorías sobre la cepa ancestral de P. infestans y su papel en las primeras epidemias.

Principales métodos:

• Amplificación y secuenciación del ADN de la región transcrita interna del espaciador 2 de 28 muestras históricas de herbario (1845-1847).
• Amplificación de una región de ADN mitocondrial variable para diferenciar entre los haplotipos de P. infestans (Ib, Ia, IIa, IIb).

Principales resultados:

• Las muestras históricas de P. infestans de 1845-1847 fueron confirmadas mediante secuenciación de ADN.
• Las lesiones de estas muestras históricas no fueron causadas por el haplotipo Ib, lo que desafía las teorías existentes.
• Una región de ADNmt variable presente en los haplotipos Ib modernos estaba ausente en estas muestras históricas.

Conclusiones:

• El genotipo US-1 (haplotipo Ib mtDNA) no fue responsable de las lesiones tardías de la plaga en las muestras históricas analizadas.
• Los hallazgos requieren una reevaluación de las teorías sobre la cepa ancestral de P. infestans y su papel en las epidemias históricas.
• Los especímenes históricos son cruciales para inferencias precisas sobre las poblaciones patógenas pasadas y la historia evolutiva.