Un complejo de ARN del bucle A del VIH-1 y el tRNA ((Lys,3) se estabiliza mediante modificaciones de nucleósidos

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• Virología Virología.
• La bioquímica es la bioquímica.

Sus antecedentes:

• El complejo de iniciación de transcripción del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) requiere interacciones específicas de ARN-ARN.
• Una interacción clave involucra el anticodón del ARNt primer y un bucle rico en A conservado en el genoma del VIH.
• El papel de las modificaciones del tRNA en la estabilización de este complejo no se entiende completamente.

Objetivo del estudio:

• Investigar el papel de los nucleósidos hipermodificados en los bucles del tallo del ARNt anticódono (ASL) en la estabilización de las interacciones ARN-ARN relevantes para la transcripción del VIH.
• Determinar la contribución de las modificaciones específicas del tRNA de fuentes bacterianas y de mamíferos a la estabilidad del complejo.

Principales métodos:

• La resonancia plasmónica de superficie (SPR) se empleó para cuantificar la afinidad de unión de las horquillas ASL de tRNA con un modelo de horquilla de bucle A.
• Los experimentos utilizaron tRNA ASLs con modificaciones de *Escherichia coli* tRNALys y tRNALys humanas,3.
• Las mediciones de afinidad se realizaron en ASLs de ARNt tRNA totalmente y parcialmente modificadas.

Principales resultados:

• Los nucleósidos hipermodificados dentro de las ASL de ARNt estabilizan significativamente las interacciones ARN-ARN en el modelo complejo anticodón/bucle A.
• Tanto el tRNALys de *E. coli* como el tRNALys humano,3 las horquillas de la ASL formaron complejos estables con la horquilla de bucle A.
• Los ASL de ARNt parcialmente modificados mostraron una afinidad de unión reducida, lo que indica contribuciones distintas de las modificaciones de ARNt de bacterias y mamíferos a la estabilización compleja.

Conclusiones:

• Los nucleósidos hipermodificados en las ASL de ARNt desempeñan un papel crítico en la estabilización de las interacciones ARN-ARN esenciales para el complejo de iniciación de la transcripción del VIH.
• Los hallazgos apoyan modelos de interacciones de ARN complementarios, similares al tRNAAsp, para el complejo anticodón / bucle A.
• Comprender estos mecanismos de estabilización ofrece objetivos potenciales para las terapias antivirales.