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Published on: May 13, 2019
Método de codificación para bibliotecas de moléculas pequeñas OBOC utilizando un enfoque bifásico para la síntesis
Xiaobing Wang1, Jinhua Zhang, Aimin Song
1Division of Hematology and Oncology, Department of Internal Medicine, UC Davis Medical Center, 4501 X Street, Sacramento, California 95817, USA.
Una nueva estrategia de codificación para las bibliotecas de una perla y un compuesto (OBOC) utiliza perlas de dos capas con etiquetas de codificación internas. Este método permite la identificación inequívoca de pequeñas moléculas, avanzando el descubrimiento de fármacos y la biología química.
Área de la Ciencia:
- Biología Química Biología química.
- La Química Combinatoria es una de las ciencias químicas.
- Descubrimiento de Drogas Descubrimiento de Drogas
Sus antecedentes:
- Las bibliotecas combinatorias One-Bead-One-Compound (OBOC) permiten una rápida síntesis y selección de un gran número de compuestos.
- La decodificación precisa de las cuentas compuestas positivas es crucial para explotar el potencial de la biblioteca OBOC.
- Los métodos de codificación existentes requieren mejoras para aplicaciones de alto rendimiento.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar una estrategia de codificación novedosa, robusta y de alto rendimiento para las bibliotecas de moléculas pequeñas OBOC.
- Para permitir la identificación estructural inequívoca de los compuestos de las cuentas positivas.
- Mejorar la eficiencia de la selección y el análisis de las bibliotecas OBOC.
Principales métodos:
- Desarrollo de un sistema de cuentas de dos capas que combine compuestos exhibidos en la superficie con etiquetas de codificación internas y descifrables.
- Utilizando un enfoque de síntesis de escalera y la codificación química dentro del interior de la perla.
- Incorporación de bromo en enlaces cleables para generar huellas dactilares de isótopos característicos para el análisis por espectrometría de masas (MALDI-TOF-MS).
- Empleando un enfoque de síntesis bifásica para la segregación topológica de las funcionalidades.
Principales resultados:
- Síntesis y validación exitosas de una biblioteca de moléculas pequeñas OBOC de 12.288 miembros utilizando la nueva estrategia de codificación.
- Determinación inequívoca de las estructuras químicas de los compuestos en cuentas positivas después del cribado contra la streptavidina.
- Demostración de que las diferencias de masa entre picos adyacentes en los espectros MALDI-TOF-MS permiten una aclaración estructural.
- La estrategia de codificación también proporciona información sobre la calidad de los compuestos exhibidos en la superficie.
Conclusiones:
- La estrategia de codificación desarrollada ofrece una poderosa herramienta para decodificar las bibliotecas combinatorias OBOC.
- Este método mejora significativamente la capacidad de identificar compuestos activos, acelerando el descubrimiento de fármacos.
- El enlazador que contiene bromo simplifica la interpretación espectral de masas y confirma la integridad del compuesto.
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