Es un retrotransposón sintético de mamíferos altamente activo

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología Molecular Biología Molecular
• Biología sintética Biología sintética.

Sus antecedentes:

• Los elementos LINE-1 (L1) son retrotransposones abundantes en los genomas de los mamíferos.
• La transcripción de L1 se ve obstaculizada por un defecto de alargamiento, lo que limita la expresión de ARN y proteínas de L1.
• Este defecto es un regulador clave de la frecuencia de transposición de L1.

Objetivo del estudio:

• Investigar métodos para superar el defecto de alargamiento transcripcional L1.
• Para mejorar la eficiencia de retrotransposición de L1 a través de la modificación de la secuencia sintética.
• Evaluar el potencial de los elementos L1 diseñados como herramientas genómicas.

Principales métodos:

• Sintetizó marcos de lectura abierta L1 a partir de oligonucleótidos sintéticos, alterando el 24% de la secuencia sin cambiar los aminoácidos.
• Se han reemplazado las secuencias L1 de tipo salvaje por versiones sintéticas en un ensayo de retrotransposición.
• ARN L1 cuantificado, niveles de proteínas y actividad de transposición.

Principales resultados:

• La resíntesis sintética de L1 aumentó significativamente los niveles de ARN y proteínas de L1 en estado estacionario.
• La actividad de retrotransposición de los elementos sintéticos L1 aumentó más de 200 veces en comparación con el tipo silvestre.
• Se demostró que las grandes secuencias de acción cis conservadas dentro de las regiones de codificación L1 no son esenciales para la retrotransposición.

Conclusiones:

• Eludir el defecto transcripcional L1 a través de la optimización de la secuencia sintética mejora dramáticamente la retrotransposición.
• Se generaron elementos sintéticos L1 altamente activos, que excedieron los niveles de actividad previamente conocidos.
• Estos elementos L1 diseñados son prometedores como nuevas herramientas para la manipulación del genoma de los mamíferos.