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Gene Conversion02:08

Gene Conversion

Other than maintaining genome stability via DNA repair, homologous recombination plays an important role in diversifying the genome. In fact, the recombination of sequences forms the molecular basis of genomic evolution. Random and non-random permutations of genomic sequences create a library of new amalgamated sequences. These newly formed genomes can determine the fitness and survival of cells. In bacteria, homologous and non-homologous types of recombination lead to the evolution of new...
DNA-only Transposons02:57

DNA-only Transposons

DNA-only transposons are called autonomous transposons since they code for the enzyme transposase that is required for the transposition mechanism. Insertion of transposons can alter gene functions in multiple ways. They can mutate the gene, alter gene expression by introducing a novel promoter or insulator sequence, introduce new splice sites, and change the mRNA transcripts produced, or remodel chromatin structure.
The donor site from where the transposon is excised is either degraded or...
Conservative Site-specific Recombination and Phase Variation02:53

Conservative Site-specific Recombination and Phase Variation

Because the DNA segments are cut and reorganized in a direction-specific manner, site-specific recombination has emerged as an efficient genetic engineering technique. Flippase and Cyclization recombinases or Flp and Cre, respectively, are two members of the tyrosine recombinase family derived from bacteriophages, that are used to mediate site-specific DNA insertions, deletions, and targeted expression of proteins in mammalian cell lines.
The recognition sites for Cre recombinase called LoxP...
Maxam-Gilbert Sequencing01:05

Maxam-Gilbert Sequencing

In the same year as the discovery of the Sanger sequencing method, another group of scientists, Allan Maxam and Walter Gilbert, demonstrated their chemical-cleavage method for DNA sequencing. The Maxam-Gilbert method relies on using different chemicals that can cleave the DNA sequence at specific sites, the separation of resulting DNA fragments of variable size using electrophoresis, and deciphering the DNA sequence from the resulting gel bands.
Challenges of the Maxam-Gilbert Method
The...

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Breaking the Myth of Enzymatic Azoreduction.

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Published on: September 5, 2010

Inyección de electrones reductores en el ADN dúplex por aminas aromáticas.

Takeo Ito1, Steven E Rokita

  • 1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA.

Journal of the American Chemical Society
|November 26, 2004
PubMed
Resumen

Los investigadores desarrollaron un nuevo ensayo para examinar las aminas aromáticas para la transferencia de carga del ADN. N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N es el nombre de la persona que se encuentra en el lugar donde se encuentra.

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Área de la Ciencia:

  • La bioquímica es la bioquímica.
  • Biología Molecular Biología Molecular
  • La fotoquímica es la fotoquímica.

Sus antecedentes:

  • Las aminas aromáticas pueden iniciar la transferencia de carga en el ADN, un proceso relevante para el daño y la reparación del ADN.
  • El desarrollo de ensayos para examinar estos compuestos y comprender los mecanismos de transferencia de carga es crucial.
  • Los métodos anteriores carecían de la sensibilidad para sondear las complejidades de la transferencia de electrones dentro del ADN.

Objetivo del estudio:

  • Desarrollar un nuevo ensayo para la detección de aminas aromáticas capaces de iniciar la transferencia de carga en el ADN a través de la donación de electrones reductores.
  • Investigar los factores que influyen en la eficiencia de la inyección y transferencia de electrones dentro del ADN utilizando un conjugado diseñado de oligodeoxinucleótido-TMDN.
  • Para aclarar el papel de la identidad de la nucleobasa en la modulación de la transferencia de carga del ADN.

Principales métodos:

  • Desarrolló un ensayo de reacción fotoinducida utilizando ADN con un residuo de bromodeoxyuridina ((Br) U) y un sitio abásico.
  • Se examinaron las aminas aromáticas por su capacidad para iniciar la transferencia de carga.
  • Preparado un oligodeoxinucleótido-TMDN conjugado para estudiar las variables que afectan a la eficiencia de la transferencia de electrones.

Principales resultados:

  • Se identificaron N,N,N',N'-tetrametil-1,5-diaminonaftaleno (TMDN) y 1,5-diaminonaftaleno (DAN) como compuestos activos.
  • El ensayo mostró una leve sensibilidad al oxígeno pero una inhibición significativa por el 2-mercaptoetanol.
  • La identidad de la nucleobasa moduló fuertemente la transferencia de carga, con una disminución de 60 veces observada cuando la adenina (A) fue reemplazada por la citosina (C) como la contrabase de TMDN.
  • Se encontró una correlación inversa entre la reducción de (Br) U y el apagado de fluorescencia TMDN por la contrabase, lo que sugiere una competencia entre la recombinación radical y la migración de electrones.

Conclusiones:

  • El ensayo desarrollado examina eficazmente las aminas aromáticas para la iniciación de la transferencia de carga del ADN.
  • La identidad de la base nuclear es un determinante crítico de la eficiencia de transferencia de carga dentro del ADN.
  • Los hallazgos apoyan un modelo en el que la migración de electrones compite con la recombinación radical en los procesos de transferencia de carga del ADN.