Predicción del resultado del cáncer con microarrays: una estrategia de validación aleatoria múltiple

Área de la Ciencia:

• Oncología Oncología.
• La bioinformática es la bioinformática.
• La genómica es la genómica.

Sus antecedentes:

• El perfil de expresión génica utilizando microarrays de ADN tiene como objetivo predecir el pronóstico del cáncer.
• La identificación de firmas moleculares podría personalizar el tratamiento del cáncer en función de la gravedad de la enfermedad.

Objetivo del estudio:

• Para volver a analizar los datos de siete grandes estudios que predicen el pronóstico del cáncer utilizando microarrays de ADN.
• Para evaluar la estabilidad de las firmas moleculares y la precisión de la clasificación.

Principales métodos:

• Expandió la estrategia estándar mediante el uso de múltiples conjuntos aleatorios de capacitación y validación.
• Evaluó la estabilidad de las firmas moleculares identificadas y sus tasas de clasificación errónea.

Principales resultados:

• Las firmas moleculares para el pronóstico del cáncer eran altamente inestables y dependían de la composición del conjunto de entrenamiento.
• La mayoría de los estudios mostraron resultados demasiado optimistas debido a una validación inadecuada; cinco de los siete estudios no tuvieron mejor resultado que el azar.
• Las tasas de clasificación errónea generalmente disminuyeron con tamaños más grandes de conjuntos de entrenamiento.

Conclusiones:

• El valor pronóstico de los estudios publicados de microarrays de ADN en el cáncer debe interpretarse con precaución.
• Se recomienda la validación mediante muestreo aleatorio repetido para garantizar la fiabilidad.