Un SNP regulador causa una enfermedad genética humana al crear un nuevo promotor transcripcional

Área de la Ciencia:

• Genética La genética.
• Biología Molecular Biología Molecular
• Hematología Hematología.

Sus antecedentes:

• La alfa talasemia es un trastorno sanguíneo hereditario que afecta la producción de hemoglobina.
• Estudios previos localizaron una forma variante en el cromosoma 16, pero las causas moleculares seguían siendo escurridizas.
• Los métodos convencionales no pudieron identificar defectos en las poblaciones melanesias afectadas.

Objetivo del estudio:

• Para dilucidar el mecanismo patogenético de una variante de la talasemia alfa.
• Para identificar el defecto molecular específico responsable del trastorno.
• Desarrollar una estrategia para la identificación de polimorfismos de un solo nucleótido de regulación funcional (rSNP).

Principales métodos:

• Estudios de asociación en poblaciones melanesias.
• Resecuenciación de la región del clúster de genes alfa-globina.
• Ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP, por sus siglas en inglés).
• Análisis de expresión utilizando matrices de oligonucleótidos de azulejos.

Principales resultados:

• Se identificó un polimorfismo regulador de un solo nucleótido de ganancia de función (rSNP).
• El rSNP se encuentra en una región no genética aguas arriba de los genes de alfa-globina.
• Este rSNP crea un nuevo elemento parecido a un promotor que interrumpe la activación de los genes de globina tipo alfa aguas abajo.

Conclusiones:

• El rSNP identificado representa un nuevo mecanismo patogenético para la alfa talasemia.
• Este hallazgo proporciona un método para distinguir los rSNP funcionales de los neutros.
• El mecanismo descubierto puede contribuir a otras enfermedades genéticas.