Las secuencias del genoma de Phytophthora revelan los orígenes evolutivos y los mecanismos de la patogénesis

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología evolutiva Biología evolutiva.
• Patología Vegetal Patología vegetal.

Sus antecedentes:

• Oömycetes, al igual que las especies de Phytophthora, son microorganismos eucariotas que incluyen patógenos vegetales significativos.
• Phytophthora sojae causa la podredumbre de la raíz de la soja, y Phytophthora ramorum causa la muerte repentina del roble.
• Oömycetes pertenecen al reino Stramenopila, que también incluye algas fotosintéticas.

Objetivo del estudio:

• Determinar el proyecto de secuencias del genoma de dos especies clave de Phytophthora: Phytophthora sojae y Phytophthora ramorum.
• Para investigar la relación evolutiva entre los oömycetes y las algas fotosintéticas.
• Identificar genes y familias de proteínas involucradas en la infección y virulencia de las plantas.

Principales métodos:

• Genómica comparativa de borradores de secuencias del genoma.
• Análisis de las familias de genes, en particular las relacionadas con las interacciones patógeno-huésped.
• Análisis filogenético para inferir las relaciones evolutivas.

Principales resultados:

• Se obtuvieron borradores de secuencias del genoma para Phytophthora sojae y Phytophthora ramorum.
• La evidencia sugiere una ascendencia fotosintética para los estramenopiles, apoyada por la presencia de genes derivados de fototróficos en Phytophthora.
• Se identificó una rápida expansión y diversificación de las familias de proteínas, incluidas las hidrolasas, los transportadores ABC, las toxinas y los genes de avirulencia, en los genomas, en particular una superfamilia de 700 proteínas similares a los conocidos factores de avirulencia de oömycete.

Conclusiones:

• Los genomas de las especies de Phytophthora proporcionan información sobre la historia evolutiva de los estramenopiles, incluido un posible vínculo con los organismos fotosintéticos.
• Las expansiones genéticas identificadas ponen de relieve la base genética de las capacidades de infección de plantas de estos oömycetes.
• La genómica comparativa de estos patógenos avanza en nuestra comprensión de la virulencia de los oömycete y los mecanismos de interacción del huésped.