Los linajes de las arqueas acidófilas fueron revelados por el análisis genómico comunitario

Área de la Ciencia:

• Microbiología y Genómica.
• Investigación de la investigación extremófila.
• Archaea Filogenética de las arqueas.

Sus antecedentes:

• Las encuestas microbianas estándar que utilizan la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) a menudo pasan por alto las especies de baja abundancia.
• Los nuevos linajes microbianos, particularmente las arqueas, pueden evadir la detección a través de métodos convencionales.
• Los entornos extremos, como el drenaje ácido de las minas, albergan comunidades microbianas únicas y poco estudiadas.

Objetivo del estudio:

• Identificar y caracterizar nuevas especies microbianas de baja abundancia.
• Explorar la diversidad arqueológica en biofilms ácidos extremos utilizando métodos independientes del cultivo.
• Investigar el papel ecológico y la morfología de organismos no reconocidos anteriormente.

Principales métodos:

• Adquisición de datos genómicos comunitarios sin reacción en cadena de la polimerasa (PCR) o cultivo.
• Reconstrucción de fragmentos de ADN que codifican el ARN ribosomal 16S (ARNr) y los genes codificadores de proteínas.
• Aplicación de sondas 16S específicas para el ARNr y microscopía electrónica de transmisión (TEM).

Principales resultados:

• Reconstrucción de ADN a partir de nuevos linajes arqueológicos con un inusual ARNr 16S y genes codificadores de proteínas.
• Estas nuevas arqueas son componentes menores en las biopelículas de soluciones de pH 0,5-1,5 en la mina de Richmond.
• Las células son pleomórficas, poseen estructuras de membrana únicas y tienen volúmenes celulares extremadamente pequeños (<0,006 μm3).
• Las sondas de ARNr 16S indican el predominio de estos organismos en la fracción de tamaño <0,45 μm.

Conclusiones:

• La genómica comunitaria es eficaz para descubrir nuevos taxones microbianos de baja abundancia.
• Nuevos linajes arqueológicos habitan y potencialmente dominan biofilms ácidos extremos.
• La morfología única sugiere adaptaciones especializadas a las condiciones oligotróficas y ácidas.