Reconocimiento del daño de la CPD mediante la transcripción de la ARN polimerasa II

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• Mecanismos de reparación del ADN.
• La bioquímica es la bioquímica.

Sus antecedentes:

• La reparación acoplada a la transcripción (TCR, por sus siglas en inglés) es crucial para la eliminación de lesiones en el ADN, como los dímeros de pirimidina de ciclobutan inducidos por luz ultravioleta (CPD, por sus siglas en inglés).
• La ARN polimerasa II (Pol II) juega un papel central en la TCR al detenerse en los sitios de daño del ADN.

Objetivo del estudio:

• Para aclarar el mecanismo basado en la estructura de la etapa inicial en la RCT eucariota: el estancamiento inducido por la DPC del Pol II.
• Para entender cómo las lesiones de ADN como las CPD impiden la progresión de la polimerasa.

Principales métodos:

• El análisis estructural de la ARN polimerasa II se estancó en los dímeros de pirimidina de ciclobutano.
• Investigando el papel de la incorrecta incorporación de nucleótidos en el estancamiento de la polimerasa.

Principales resultados:

• Una CPD en la hebra de ADN transcrita entra en el sitio activo Pol II, dirigiendo la incorporación errónea de uridina en el ARN naciente.
• Esta incorporación errónea de la uridina bloquea la translocación de la polimerasa, causando el estancamiento.
• La sustitución de la uridina por adenosina permite el bypass de la DPC, lo que confirma que la incorporación errónea dirigida por la DPC es clave para el estancamiento.
• La conformación de la polimerasa estancada permanece sin cambios, con la lesión inaccesible.

Conclusiones:

• El estancamiento de Pol II en las CPD está mediado por la incorporación errónea de la uridina dirigida por la lesión, no por cambios alostéricos en la polimerasa.
• El complejo estancado facilita el reclutamiento no alostérico de factores de reparación para la escisión de la lesión.