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Genome comparison is one of the excellent ways to interpret the evolutionary relationships between organisms. The basic principle of genome comparison is that if two species share a common feature, it is likely encoded by the DNA sequence conserved between both species. The advent of genome sequencing technologies in the late 20th century enabled scientists to understand the concept of conservation of domains between species and helped them to deduce evolutionary relationships across diverse...
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In analytical chemistry, we often perform repetitive measurements to detect and minimize inaccuracies caused by both determinate and indeterminate errors. Despite the cares we take, the presence of random errors means that repeated measurements almost never have exactly the same magnitude. The collective difference between these measurements - observed values - and the estimated or expected value is called uncertainty. Uncertainty is conventionally written after the estimated or expected value.
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The atomic mass of an element varies due to the relative ratio of its isotopes. A sample's relative proportion of oxygen isotopes influences its average atomic mass. For instance, if we were to measure the atomic mass of oxygen from a sample, the mass would be a weighted average of the isotopic masses of oxygen in that sample. Since a single sample is not likely to perfectly reflect the true atomic mass of oxygen for all the molecules of oxygen on Earth, the mass we obtain from this particular...

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Updated: Jul 8, 2026

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Published on: November 3, 2010

La incertidumbre de alineación y el análisis genómico.

Karen M Wong1, Marc A Suchard, John P Huelsenbeck

  • 1Section of Ecology, Behavior and Evolution, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA.

Science (New York, N.Y.)
|January 26, 2008
PubMed
Resumen
Este resumen es generado por máquina.

Los métodos estadísticos para el análisis de datos genómicos pasan por alto la incertidumbre de alineación de secuencias. Esto puede hacer que diferentes métodos de alineación produzcan conclusiones contradictorias en estudios comparativos de genómica.

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An Allele-specific Gene Expression Assay to Test the Functional Basis of Genetic Associations

Published on: November 3, 2010

Área de la Ciencia:

  • La genómica es la genómica.
  • La bioinformática es la bioinformática.
  • Biología computacional Biología computacional.

Sus antecedentes:

  • Los métodos estadísticos actuales para el análisis de datos genómicos asumen que las alineaciones de secuencias son precisas.
  • Esta suposición a menudo se viola en la genómica comparativa, donde se analizan miles de genes, muchos de los cuales son difíciles de alinear.

Objetivo del estudio:

  • Para investigar el impacto de la incertidumbre de alineación de secuencias en los análisis genómicos comparativos.
  • Para demostrar cómo esta incertidumbre puede afectar las conclusiones del estudio.

Principales métodos:

  • Se utilizaron datos genómicos de siete especies de levaduras.
  • Métodos estadísticos estándar aplicados para el análisis de datos genómicos.

Principales resultados:

  • Se demostró que la incertidumbre de alineación de secuencias introduce problemas significativos en la genómica comparativa.
  • Los diferentes métodos de alineación produjeron conclusiones divergentes cuando se aplicaron al mismo conjunto de datos.

Conclusiones:

  • Es crucial tener en cuenta la incertidumbre de alineación de secuencias en la genómica comparativa.
  • Ignorar esta incertidumbre puede conducir a hallazgos poco fiables o contradictorios.