Redirigir la trayectoria plegable del dominio ankyrin de Notch remodelando el paisaje energético

Área de la Ciencia:

• La ingeniería de proteínas es la ingeniería de proteínas.
• La biofísica es la biofísica.
• Biología estructural Biología estructural.

Sus antecedentes:

• Las proteínas de repetición son modulares y susceptibles al diseño de proteínas.
• Los dominios de repetición diseñados por consenso exhiben una mayor estabilidad térmica.
• Trabajos anteriores demostraron la remodelación del paisaje energético del dominio de Notch ankyrin mediante la adición de repeticiones del terminal C.

Objetivo del estudio:

• Para investigar cómo la remodelación del paisaje energético afecta el mecanismo de plegado de las proteínas repetidas.
• Para entender la respuesta de las vías de plegado a las modificaciones en la estructura de la proteína.
• Para explorar el papel de las energías locales en la selección de vías de plegado.

Principales métodos:

• Utilizando sustituciones análogas de una alanina conservada con glicina en cada repetición.
• Analizando conjuntos de estado de transición de construcciones de dominio de ankyrin Notch diseñadas (Nank1-5C1 y Nank1-5C2).
• Comparando la cinética de plegado de construcciones de tipo salvaje y construcciones de ingeniería.

Principales resultados:

• Sustituciones en repeticiones centrales lentas tipo salvaje plegamiento del dominio ankyrin de Notch.
• Las sustituciones en el terminal C repiten el plegado lento de las construcciones Nank1-5C1 y Nank1-5C2 de ingeniería.
• La adición de repeticiones del extremo C desplaza el conjunto de estados de transición hacia el extremo C, alterando la trayectoria de plegado.

Conclusiones:

• Las proteínas de repetición de ingeniería mediante la adición de repeticiones estabilizadoras del C-terminal redirigen la vía de plegado.
• La trayectoria de plegado del dominio de ankyrin de Notch se selecciona en función de las energías locales.
• Este estudio proporciona información sobre la relación entre la estructura de las proteínas, el paisaje energético y los mecanismos de plegado.