Los siRNAs endógenos de los dsRNAs formados naturalmente regulan las transcripciones en los ovocitos de ratón

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• Genética La genética.
• La epigenética es la epigenética.

Sus antecedentes:

• La interferencia de ARN (RNAi) es un mecanismo de silenciamiento de genes específico de la secuencia que involucra ARN de doble cadena (dsRNA).
• Los ARN pequeños interferentes endógenos (siARN) generalmente requieren ARN polimerasa ARN dependiente de ARN (RdRP) para su biogénesis y función.
• El papel y el origen de los siRNAs endógenos en los mamíferos, que carecen de actividad RdRP, siguen siendo en gran medida no caracterizados.

Objetivo del estudio:

• Para investigar la biogénesis y la función de los siRNAs endógenos en los ovocitos de ratón.
• Identificar las fuentes y las funciones reguladoras de los ARN pequeños en los ovocitos de mamíferos.
• Para dilucidar la participación de la vía RNAi en la regulación de genes y retrotransposones en ausencia de RdRP.

Principales métodos:

• Secuenciación profunda de pequeños ARN en ovocitos de ratón en crecimiento.
• Análisis de pequeñas secuencias y orígenes de ARN interferentes (siRNAs) y ARN Piwi-interactivos (piRNAs).
• Evaluación de la expresión de genes y retrotransposones en ovocitos de ratón nocaut Dicer y Ago2.

Principales resultados:

• Identificación de piRNAs abundantes unidos a Mili y siRNAs derivados de retrotransposones y transcripciones codificadoras de proteínas.
• Demostración de que los dsRNAs naturales, de fuentes como repeticiones invertidas y transcripciones antisense, generan siRNAs.
• La evidencia de que la pérdida de Dicer o Ago2 conduce a la reducción de siRNA y el aumento de los niveles de transcripción objetivo, lo que confirma la función de la vía de RNAi.

Conclusiones:

• Los siRNAs endógenos están presentes y son funcionales en los ovocitos de mamíferos, regulando tanto los genes codificadores de proteínas como los retrotransposones.
• Los organismos de mamíferos que carecen de RdRP pueden generar siRNAs endógenos funcionales a partir de dsRNAs endógenos.
• Los pseudogenes pueden servir como precursores de los siRNA, contribuyendo a la regulación de sus mRNAs fuente fundadoras a través del RNAi.