El ARN no codificante del aire epigenéticamente silencia la transcripción al dirigir G9a a la cromatina

Área de la Ciencia:

• La epigenética es la epigenética.
• Biología Molecular Biología Molecular
• La genómica es la genómica.

Sus antecedentes:

• Se sabe que los grandes ARN no codificantes (ARNnc) silencian epigenéticamente los genes, pero los mecanismos siguen sin estar claros.
• El Air ncRNA está impreso, lo que significa que se expresa solo desde el alelo paterno.
• El aire es esencial para el silenciamiento específico del alelo de los genes cercanos, incluido Slc22a3, en la placenta del ratón.

Objetivo del estudio:

• Investigar el mecanismo por el cual el Air ncRNA silencia epigenéticamente la expresión génica.
• Determinar el papel del Air ncRNA en la regulación de la transcripción del gen Slc22a3.
• Para identificar las interacciones moleculares involucradas en el silenciamiento de genes mediado por el aire.

Principales métodos:

• Inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP) para evaluar la interacción del aire con el promotor Slc22a3 cromatina.
• Análisis de los niveles de metilación de H3K9 en el promotor Slc22a3.
• Ablación genética del gen G9a para estudiar su papel en el silenciamiento mediado por aire.
• Usar aire truncado para evaluar su función en el reclutamiento de promotores y silenciamiento de genes.

Principales resultados:

• El aire ncRNA interactúa con el promotor Slc22a3 cromatina y la H3K9 metiltransferasa G9a en la placenta del ratón.
• La acumulación de aire en el promotor Slc22a3 se correlaciona con el aumento de la metilación de H3K9 y la represión transcripcional.
• La deleción genética de G9a conduce a la transcripción bialélica y no impresa de Slc22a3.
• Truncated Air no se localiza en el promotor Slc22a3, perjudica el reclutamiento de G9a y da como resultado una transcripción bialélica.

Conclusiones:

• El Air ncRNA se dirige a las enzimas represivas modificadoras de histonas, como G9a, a dominios específicos de la cromatina.
• Esta interacción conduce a la metilación localizada de H3K9 y al silenciamiento epigenético de genes diana como Slc22a3.3.
• Los hallazgos sugieren un mecanismo general de cómo los grandes ncRNAs median el silenciamiento de genes epigenéticos.