Estructura de la (E) -4-hidroxi-3-metil-but-2-enil difosfato reductasa, la enzima terminal de la vía de los no mevalonatos, también conocida como la vía de los mevalonatos

Área de la Ciencia:

• La bioquímica es la bioquímica.
• Biología Estructural Biología estructural.
• Evolución molecular de la evolución molecular.

Sus antecedentes:

• Existen dos vías metabólicas primarias, el mevalonato y el 2-C-metil-D-eritritol-4-fosfato (MEP), para la biosíntesis de isoprenoides.
• La vía MEP es vital en bacterias patógenas, protozoos parásitos como Plasmodium falciparum y plantas, pero está ausente en los animales.
• LytB (HMBPP reductasa) cataliza el paso final de la vía MEP, convirtiendo HMBPP en IPP y DMAPP.

Objetivo del estudio:

• Para dilucidar la estructura molecular de Aquifex aeolicus LytB.
• Proporcionar conocimientos estructurales sobre el mecanismo catalítico de la enzima terminal de la vía MEP.

Principales métodos:

• Se utilizó la cristalografía de rayos X para determinar la estructura de Aquifex aeolicus LytB.
• Se realizó un análisis estructural de alta resolución (1.65 Å).

Principales resultados:

• La proteína LytB exhibe una estructura de hoja de trébol / trébol, con cada monómero que contiene tres dominios alfa / beta.
• Un grupo central de [Fe3S4] está ligado por Cys13, Cys96 y Cys193.
• Los residuos conservados His42, His124 y Glu126 se encuentran en el sitio activo, se propone que estén involucrados en la unión al sustrato y la catálisis.

Conclusiones:

• La estructura determinada revela los principales residuos catalíticos y proporciona un modelo para la unión del sustrato y la formación de productos.
• Comprender la estructura de LytB es crucial para atacar la vía MEP en los patógenos.