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Updated: Jun 27, 2026

Mapping the Binding Site of an Aptamer on ATP Using MicroScale Thermophoresis
Published on: January 7, 2017
Aplicación de la selección de afinidad/espectrometría de masas para determinar el isómero estructural de las
Gregory C Adam1, Craig A Parish, Douglas Wisniewski
1Target Validation Chemistry, Natural Products Chemistry, and Infectious Diseases, Merck Research Laboratories, Merck and Company, P.O. Box 2000, Rahway, New Jersey 07065, USA. gregory_adam@merck.com
Los investigadores identificaron nuevos compuestos antifúngicos llamados parnafunginas que se dirigen a la poliadenosina polimerasa (PAP). Usando la espectrometría de afinidad-selección/masa, encontraron que el isómero recto (parnafungina A) es más efectivo contra Candida albicans.
Área de la Ciencia:
- La micología de la micología.
- Química Medicinal La Química Medicinal es el campo de la Química Medicinal.
- La bioquímica es la bioquímica.
Sus antecedentes:
- El desarrollo de tratamientos antifúngicos de amplio espectro, seguros y biodisponibles por vía oral requiere nuevas estrategias de descubrimiento.
- Candida albicans es un hongo patógeno clínicamente relevante que requiere intervenciones terapéuticas efectivas.
- La prueba de aptitud de Candida albicans es una plataforma de detección de células enteras para identificar compuestos antifúngicos y sus mecanismos de acción.
Objetivo del estudio:
- Identificar nuevos productos antifúngicos naturales con actividad de amplio espectro y características favorables.
- Investigar el mecanismo de acción de los compuestos antifúngicos recién descubiertos.
- Para determinar el isómero de unión preferido de las parnafunginas a la poliadenosina polimerasa (PAP).
Principales métodos:
- Cribado de células enteras utilizando el test de aptitud de Candida albicans para identificar los compuestos activos de los extractos de productos naturales.
- Ensayos bioquímicos para investigar los efectos inhibidores de los compuestos identificados en la poliadenosina polimerasa (PAP).
- Aplicación de la selección de afinidad/espectrometría de masas (AS-MS) para diferenciar las afinidades de unión de los isómeros de la parnafungina.
Principales resultados:
- Identificación de una nueva familia de productos naturales antifúngicos, llamados parnafunginas, a partir de extractos de productos naturales.
- Se descubrió que las parnafunginas inhiben la poliadenosina polimerasa (PAP), una enzima crucial en el procesamiento del ARNm.
- La selección de afinidad/espectrometría de masas demostró que el isómero recto, la parnafungina A, se une preferentemente al PAP en lugar del isómero doblado, la parnafungina B.
Conclusiones:
- Las parnafunginas representan una nueva clase de agentes antifúngicos dirigidos a la PAP.
- El isómero recto, la parnafungina A, exhibe una mayor afinidad por la PAP, lo que sugiere su potencial como compuesto de plomo.
- AS-MS es un método eficaz para caracterizar isómeros con rápida interconversión, superando las limitaciones de los ensayos bioquímicos estándar.
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