Genómica de poblaciones de levaduras domésticas y silvestres

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología evolutiva Biología evolutiva.
• Microbiología Microbiología.

Sus antecedentes:

• La secuenciación del genoma de Saccharomyces cerevisiae ha avanzado en la comprensión de la evolución del genoma.
• Existe un conocimiento limitado sobre las historias de vida de las levaduras silvestres, las distribuciones ecológicas y las estructuras de población.
• Los procesos evolutivos que impulsan la adaptación, la variación fenotípica y el aislamiento reproductivo en las poblaciones de levaduras no se comprenden completamente a nivel de todo el genoma.

Objetivo del estudio:

• Para analizar la variación de todo el genoma en Saccharomyces cerevisiae y Saccharomyces paradoxus.
• Para investigar la estructura de la población y las relaciones evolutivas de estas especies de levaduras.
• Comprender el papel de los procesos evolutivos y la influencia humana en la diversidad de las levaduras.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma completo de más de setenta aislamientos de Saccharomyces cerevisiae y Saccharomyces paradoxus.
• Análisis del contenido genético, los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), las inserciones/deleciones (indels), las variaciones del número de copias (CNVs) y los elementos transponibles.
• Análisis filogenético para correlacionar la variación fenotípica con las relaciones de todo el genoma.

Principales resultados:

• La variación fenotípica generalmente se correlaciona con las relaciones filogenéticas globales de todo el genoma.
• Las poblaciones de Saccharomyces paradoxus exhiben una clara delimitación geográfica.
• Los aislados de Saccharomyces cerevisiae muestran menos diferenciación a nivel mundial, comparable a una sola población de S. paradoxus, lo que indica un cruce extenso.
• La estructura de la población de Saccharomyces cerevisiae sugiere múltiples linajes geográficamente aislados y formas de mosaico, en lugar de unos pocos eventos de domesticación.

Conclusiones:

• La influencia humana facilitó el cruce entre los linajes de Saccharomyces cerevisiae, creando nuevas combinaciones de variaciones existentes.
• La estructura de la población de Saccharomyces cerevisiae es compleja, moldeada tanto por el aislamiento geográfico como por la mezcla mediada por el hombre.
• Comprender la genética de las poblaciones de levaduras proporciona información sobre los procesos de adaptación y especiación.