KDM1B es una histona H3K4 desmetilasa requerida para establecer huellas genómicas maternas

Área de la Ciencia:

• La epigenética es la epigenética.
• La genómica es la genómica.
• Biología del desarrollo Biología del desarrollo.

Sus antecedentes:

• La impresión genómica regula la expresión génica específica del origen parental a través de la metilación del ADN diferencial.
• De novo las ADN metiltransferasas DNMT3A y DNMT3L son esenciales para establecer estas huellas de metilación durante la gametogénesis.
• Todavía no están claros los mecanismos precisos para dirigir la maquinaria de metilación de novo a loci específicos impresos en la línea germinal.

Objetivo del estudio:

• Para investigar el papel de la amina oxidasa (que contiene flavina) dominio 1 (AOF1), renombrado lisina desmetilasa 1B (KDM1B), en la metilación del ADN de la línea germinal y la impresión genómica.
• Para determinar la función de KDM1B como una histona H3 lisina 4 (H3K4) desmetilasa en los ovocitos.

Principales métodos:

• La orientación genética para interrumpir el gen KDM1B en ratones.
• Análisis de los niveles de metilación de H3K4 en ovocitos de hembras con deficiencia de KDM1B.
• Evaluación de las huellas de metilación del ADN y la expresión génica en los loci impresos en los ovocitos y los embriones resultantes.

Principales resultados:

• KDM1B está altamente expresado en los ovocitos en crecimiento, coincidiendo con el establecimiento de la huella.
• La deficiencia de KDM1B dio lugar a un aumento de la metilación de H3K4 y al fracaso de establecer marcas de metilación del ADN en varios genes impresos.
• Los embriones de ovocitos con deficiencia de KDM1B exhibieron expresión genética / supresión bialélica y murieron antes de la mitad de la gestación.

Conclusiones:

• La desmetilación de la histona H3K4 por KDM1B es crítica para el correcto establecimiento de las huellas de metilación del ADN durante la oogénesis.
• KDM1B juega un papel vital en la regulación de la expresión génica impreso esencial para el desarrollo embrionario.