Evolución mutacional en un tumor lobular de mama perfilado en resolución de un solo nucleótido

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología del cáncer Biología del cáncer.
• Oncología Molecular Oncología Molecular

Sus antecedentes:

• La secuenciación de próxima generación permite una caracterización detallada de las mutaciones somáticas en el cáncer.
• Comprender la evolución del cáncer requiere analizar los cambios genéticos a lo largo del tiempo.

Objetivo del estudio:

• Para secuenciar profundamente el genoma y el transcriptoma de un cáncer de mama lobular metastásico alfa positivo para receptores de estrógeno.
• Para comparar las mutaciones somáticas en la metástasis con el tumor primario de 9 años antes.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma entero y del transcriptoma entero en una alta cobertura (>43 veces).
• Análisis comparativo de mutaciones somáticas entre tumores primarios y metastásicos.
• Identificación de los eventos de edición de ARN.

Principales resultados:

• Se identificaron 32 mutaciones codificantes somáticas no sinónimas en la metástasis.
• Cinco mutaciones prevalecían en el tumor primario, seis eran de frecuencias más bajas y 19 eran nuevas.
• Se descubrieron dos nuevos eventos de edición de ARN en SRP9 y COG3.

Conclusiones:

• La heterogeneidad mutacional de un solo nucleótido puede existir en los cánceres de mama primarios.
• La evolución genética significativa ocurre durante la progresión del cáncer de mama.
• La secuenciación de alta profundidad proporciona información sobre la evolución del tumor y la heterogeneidad.