El panorama de la alteración somática del número de copias en los cánceres humanos

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología del cáncer Biología del cáncer.
• Oncología Molecular Oncología Molecular

Sus antecedentes:

• La identificación de genes que impulsan el cáncer (oncogénesis) es crucial para el desarrollo de terapias dirigidas.
• Las alteraciones del número de copias somáticas (SCNA) son cambios genómicos frecuentes en el cáncer.
• El análisis de los SCNA en diversos tipos de cáncer puede revelar factores genéticos compartidos.

Objetivo del estudio:

• Identificar nuevos genes con roles causales en la oncogénesis mediante el análisis de datos SCNA de alta resolución.
• Determinar la frecuencia y distribución de los SCNA focales en múltiples tipos de cáncer humano.
• Investigar la importancia funcional de los SCNA identificados y los genes asociados en la supervivencia de las células cancerosas.

Principales métodos:

• Análisis de alta resolución de las alteraciones del número de copias somáticas (SCNA) de 3.131 muestras de cáncer en 26 tipos histológicos.
• Identificación de las regiones SCNA focales alteradas con frecuencias significativas en múltiples tipos de cáncer.
• Análisis bioinformático para identificar familias de genes enriquecidos y vías dentro de las regiones SCNA.
• Ensayos funcionales para evaluar el impacto de las amplificaciones genéticas en la supervivencia de las células cancerosas.

Principales resultados:

• Se identificaron 158 regiones de SCNA focal con una frecuencia significativa en varios tipos de cáncer.
• 122 de estas regiones no contenían genes diana previamente conocidos para el cáncer.
• Las familias de genes que incluyen BCL2 y la vía NF-kappaBeta se enriquecieron en estas nuevas regiones SCNA.
• Las células cancerosas con amplificaciones de MCL1 y BCL2L1 mostraron dependencia de estos genes anti-apoptóticos para la supervivencia.
• La mayoría de los SCNA identificados fueron compartidos entre diferentes tipos de cáncer individuales.

Conclusiones:

• El análisis frecuente de SCNA es un método poderoso para descubrir nuevos genes impulsores del cáncer.
• Varios nuevos oncogenes candidatos y vías asociadas al cáncer fueron identificados a través del perfil SCNA.
• Los hallazgos sugieren que apuntar a genes antiapoptóticos específicos como MCL1 y BCL2L1 podría ser una estrategia terapéutica.
• La prevalencia de SCNAs compartidas en todos los tipos de cáncer indica mecanismos subyacentes comunes y el potencial para las terapias de cáncer cruzado.