Impacto funcional de la variación global del número de copias raras en los trastornos del espectro autista

Área de la Ciencia:

• Genética La genética.
• Trastornos del desarrollo neurológico Trastornos del desarrollo neurológico
• La bioinformática es la bioinformática.

Sus antecedentes:

• Los trastornos del espectro autista (TEA) son condiciones complejas de desarrollo neurológico caracterizadas por interacción social y déficits de comunicación, junto con comportamientos restringidos.
• Si bien la heredabilidad es alta (~ 90%), las causas genéticas específicas de TEA siguen siendo en gran medida no identificadas.
• El desarrollo cognitivo en individuos con TEA es muy variable, que van desde la inteligencia por encima de la media a la discapacidad intelectual.

Objetivo del estudio:

• Investigar las características de todo el genoma de las variaciones raras del número de copias (CNV) en individuos con TEA.
• Identificar nuevos factores genéticos y vías asociadas con la etiología de las TEA.
• Para comparar la carga de las CNV raras en los casos de TEA frente a los controles emparejados.

Principales métodos:

• Análisis de las CNV de todo el genoma utilizando matrices densas de genotipado.
• Comparación de las VNC raras (frecuencia <1%) entre 996 individuos con TEA y 1.287 controles de ascendencia europea.
• Identificación de los VNC de novo y hereditarios, incluidos los eventos familiares.

Principales resultados:

• Los casos de TEA exhibieron una carga global significativamente mayor de VNC genéticos raros en comparación con los controles (1.19 veces, P = 0.012).
• Se observó un mayor enriquecimiento de las CNV en los loci previamente asociados con TEA y / o discapacidad intelectual (1,69 veces, P = 3,4 x 10 ((-4)).).
• Se identificaron nuevos genes asociados con TEA (por ejemplo, SHANK2, SYNGAP1, DLGAP2, DDX53-PTCHD1) y conjuntos de genes funcionales interrumpidos (proliferación celular, señalización GTPasa / Ras).

Conclusiones:

• Las CNV raras representan un factor genético significativo que contribuye al TEA.
• El estudio implica numerosos genes y vías novedosos en la patogénesis de las TEA.
• Los hallazgos proporcionan una base para la comprensión de las vías biológicas conectadas en ASD.