Un locus trans-activo regula una red de expresión antiviral y el riesgo de diabetes tipo 1

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Inmunología Inmunología.
• Genética de sistemas Genética de sistemas.

Sus antecedentes:

• Los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) por sí solos pueden no dilucidar completamente la etiología común de la enfermedad.
• Los avances en la genómica de ratas permiten enfoques sofisticados de sistemas genéticos.
• Las redes genéticas combinadas con la variación del ADN ofrecen ideas más profundas.

Objetivo del estudio:

• Identificar las redes de genes y sus loci reguladores utilizando enfoques integrados de todo el genoma en múltiples tejidos de rata.
• Investigar el papel de estas redes en la susceptibilidad a enfermedades, específicamente la diabetes tipo 1 (DT1).

Principales métodos:

• Análisis integrados de todo el genoma en siete tejidos de rata.
• Definición de una red inflamatoria impulsada por el factor regulador del interferón 7 (IRF7) (IDIN).
• Análisis del locus del gen 2 (Ebi2/Gpr183) inducido por el virus de Epstein-Barr y su regulación del IDIN.

Principales resultados:

• Una red inflamatoria impulsada por IRF7 (IDIN), un biomarcador para los macrófagos, fue identificada y regulada por un locus en el cromosoma 15q25 de la rata.
• Se encontró que el gen Ebi2 (Gpr183) en este locus se expresa en los macrófagos y regula el IDIN.
• El locus ortólogo humano en el cromosoma 13q32 controlaba un IDIN conservado en monocitos y se asoció con el riesgo de DT1 a través de SNP rs9585056, vinculado a la expresión de EBI2.

Conclusiones:

• Los genes IDIN identificados y su locus regulador están implicados en la patogénesis de la diabetes tipo 1 (DT1).
• El estudio demuestra la utilidad de los enfoques integrados de sistemas genéticos para descubrir los mecanismos de la enfermedad.
• Los mecanismos reguladores conservados en todas las especies resaltan posibles objetivos terapéuticos para las enfermedades autoinmunes.