La proteómica de interacción cuantitativa y el perfil genómico de las marcas epigenéticas de histona y sus lectores

Área de la Ciencia:

• Epigenética y Biología Molecular.
• Biología de la cromatina Biología de la cromatina
• La proteómica es la proteómica.

Sus antecedentes:

• Las modificaciones de trimetil-lisina (me3) en las histonas son marcas epigenéticas estables.
• Estas marcas son cruciales para la regulación de la expresión génica mediada por la cromatina.

Objetivo del estudio:

• Para identificar y caracterizar las proteínas que se unen a la histona trimetil-lisina. marcas.
• Para dilucidar las funciones funcionales de estos complejos de proteínas en la regulación génica.

Principales métodos:

• Espectrometría de masas cuantitativa de alta precisión para identificar las proteínas de unión.
• Proteómica de interacción de las proteínas BAC-GFP-etiquetadas de longitud completa para asignar proteínas a complejos.
• Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-Seq) para mapear los sitios de unión genómica.

Principales resultados:

• Identificó complejos proteicos específicos, incluidos SAGA y ORC, que se unen a distintas marcas de histona trimetil-lisina.
• El complejo SAGA se une a H3K4me3 a través del dominio Tudor de Sgf29.
• El dominio PWWP se identifica como un potencial motivo de unión H3K36me3.
• El complejo ORC, con LRWD1, se une a los sitios de metilación represiva de la lisina.

Conclusiones:

• Los complejos especializados de proteínas actúan como "lectores" para marcas específicas de trimetil-lisina.
• Este mecanismo de lectura está muy extendido y media la expresión génica.
• Reveló una sofisticada interacción entre las marcas histónicas y los complejos proteicos para el control genético.