Análisis epigenómico comparativo de la adipogénesis murina y humana

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• La epigenética es la epigenética.
• La diferenciación celular es la diferenciación celular.

Sus antecedentes:

• La adipogénesis, el proceso de formación de células grasas, implica una compleja regulación génica.
• Comprender los mecanismos epigenéticos que impulsan la adipogénesis es crucial para la investigación metabólica.

Objetivo del estudio:

• Para generar y comparar mapas del estado de la cromatina en todo el genoma, perfiles de unión al factor de transcripción y datos de expresión génica en modelos de adipogénesis murina y humana.
• Identificar y caracterizar los elementos cis-reguladores implicados en la diferenciación de los preadipocitos y los adipocitos.
• Investigar la dinámica evolutiva de los elementos reguladores e identificar nuevos reguladores de la adipogénesis.

Principales métodos:

• Generación de mapas del estado de la cromatina en todo el genoma (por ejemplo, ChIP-seq para modificaciones de histonas).
• Mapeo de localización de PPARγ (receptor gamma activado por el proliferador de peroxisomas) y CTCF (factor de unión al CCCTC).
• Perfiles de expresión génica (por ejemplo, ARN-seq).
• Análisis de secuencias y ensayos reporteros para la validación funcional de elementos reguladores y motivos de factores de transcripción.
• Identificación de factores de transcripción (por ejemplo, PLZF, SRF) utilizando el análisis de la accesibilidad de la cromatina y el análisis de motivos.

Principales resultados:

• Mapas de alta resolución de la remodelación de la cromatina durante la adipogénesis en ambas especies.
• Identificación de miles de presuntos elementos cis-reguladores específicos de los preadipocitos y adipocitos.
• Diferencias significativas en la ubicación de los elementos reguladores entre los modelos murino y humano, incluso en lugares conservados.
• La evidencia de la rotación evolutiva de los motivos de unión del factor de transcripción como un impulsor de estas diferencias.
• Identificación y validación del PLZF (dedo de zinc de la leucemia promyelocítica) y del SRF (factor de respuesta sérica) como nuevos reguladores de la adipogénesis.

Conclusiones:

• La dinámica de la cromatina proporciona información clave sobre la adipogénesis.
• Los cambios evolutivos en los elementos cis-reguladores contribuyen a la regulación génica específica de la especie durante la adipogénesis.
• PLZF y SRF son reguladores validados del proceso de adipogénesis.