Un mapa de la variación del genoma humano a partir de la secuenciación a escala de población

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Genética Humana Genética Humana.
• La bioinformática es la bioinformática.

Sus antecedentes:

• El Proyecto 1000 Genomas tiene como objetivo caracterizar profundamente la variación de la secuencia del genoma humano.
• Comprender las relaciones genotipo-fenotipo requiere un conjunto de datos de variación genética completo.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y comparar estrategias de secuenciación de todo el genoma utilizando plataformas de alto rendimiento.
• Para crear un conjunto de datos fundamentales de la variación genética humana para futuras investigaciones.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma completo de baja cobertura de 179 individuos en cuatro poblaciones.
• Secuencia de alta cobertura de dos tríos padre-hijo.
• Secuenciación dirigida a exones de 697 individuos de siete poblaciones.

Principales resultados:

• Catalogó ~15 millones de polimorfismos de un solo nucleótido, 1 millón de inserciones/eliminaciones cortas y 20.000 variantes estructurales, la mayoría de las cuales no habían sido descritas anteriormente.
• Capturado >95% de la variación genética humana común accesible en los individuos.
• Se estima que la tasa de mutación de la línea germinal de novo es de ~10^-8 por par de bases por generación.

Conclusiones:

• La fase piloto catalogó con éxito la variación genética humana común, proporcionando un valioso recurso para estudios de asociación y funcionales.
• Los datos revelan ideas sobre la selección natural, mostrando una reducción de la variación cerca de los genes debido a la selección vinculada.
• Los métodos desarrollados y los datos públicos facilitarán las fases posteriores de la investigación genética humana.