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Nuevos sustratos fluorogénicos para el análisis de las proteasas retrovirales por transferencia de energía de
E D Matayoshi1, G T Wang, G A Krafft
1Pharmaceutical Discovery Division, Abbott Laboratories, Abbott Park, IL 60064.
Resumen
Se desarrolló un nuevo ensayo de transferencia de energía por resonancia de fluorescencia (RET) para medir la actividad de la proteasa 1 del virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1 PR). Este ensayo permite la identificación rápida de nuevos fármacos terapéuticos para el SIDA mediante el monitoreo del procesamiento de la poliproteína viral.
Área de la Ciencia:
- La bioquímica es la bioquímica.
- Biología Molecular Biología Molecular
- Descubrimiento de Drogas Descubrimiento de Drogas
Sus antecedentes:
- La proteasa 11-kD (PR) del virus de la inmunodeficiencia humana 1 (VIH-1) es crucial para la maduración viral y un objetivo clave para las terapias del síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA).
- Los métodos existentes para estudiar la actividad PR del VIH-1, como la HPLC y la electroforesis, requieren mucho tiempo y son menos precisos para el análisis cinético.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar un nuevo ensayo continuo para la actividad PR del VIH-1 utilizando la transferencia de energía de resonancia de fluorescencia intramolecular (RET).
- Facilitar el descubrimiento de nuevos inhibidores PR del VIH-1 y permitir estudios enzimáticos detallados.
Principales métodos:
- Se sintetizó un sustrato fluorogénico apagado (DABCYL-Ser Gln Asn Tyr Pro Ile Val Gln-EDANS) derivado de un sitio natural de procesamiento de PR del VIH-1.
- El ensayo mide aumentos dependientes del tiempo en la intensidad de fluorescencia resultante de la escisión específica del sustrato por el VIH-1 PR.
- Un sustrato similar fue diseñado para la proteasa relacionada con el virus de la mieloblastosis aviar (VMA).
Principales resultados:
- El ensayo RET demostró la escisión específica del sustrato en el enlace Tyr-Pro por HIV-1 PR, lo que lleva a un aumento lineal de la fluorescencia.
- El ensayo mostró un aumento de 40,0 veces en el rendimiento cuántico de fluorescencia por mol de sustrato escindido para HIV-1 PR.
- Se observó un aumento de 34,4 veces en el rendimiento cuántico de fluorescencia para el sustrato AMV PR.
Conclusiones:
- El ensayo basado en RET desarrollado es simple, rápido y preciso para determinar las tasas de reacción de las proteasas retrovirales.
- Este método ofrece ventajas significativas sobre los ensayos tradicionales de HPLC y electroforesis para la determinación de la actividad PR del VIH-1.
- El ensayo es valioso para el análisis cinético, la detección de inhibidores y la enzimología detallada de las proteasas virales.