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Robusta computación multicelular que utiliza puertas NOR genéticamente codificadas y "cables" químicos.

Alvin Tamsir1, Jeffrey J Tabor, Christopher A Voigt

  • 1Department of Biochemistry and Biophysics, University of California, San Francisco, California 94158, USA.

Nature
|December 15, 2010
PubMed
Resumen

Los científicos diseñaron bacterias para realizar cálculos complejos utilizando circuitos genéticos y comunicación célula-célula. Este enfoque de biología sintética permite puertas lógicas robustas, allanando el camino para nuevas aplicaciones de computación biológica.

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Área de la Ciencia:

  • Biología sintética Biología sintética.
  • Biología computacional Biología computacional.
  • La ingeniería microbiana es la ingeniería microbiana.

Sus antecedentes:

  • La organización y el desarrollo celular dependen de la computación y la comunicación célula-célula.
  • Las bacterias en las biopelículas exhiben patrones emergentes de operaciones individuales simples.

Objetivo del estudio:

  • Para diseñar un circuito genético en E. coli capaz de complejos cálculos espaciales.
  • Para utilizar la detección de quórum como un mecanismo de comunicación para las puertas lógicas biológicas.

Principales métodos:

  • Construyó una puerta lógica NOR utilizando promotores en tándem y un sistema represor en Escherichia coli.
  • Dispositivos integrados de emisor y receptor ortogonales de detección de quórum para conectar puertas lógicas.
  • Colonias bacterianas dispuestas espacialmente para crear diversas funciones computacionales.

Principales resultados:

  • Produjo con éxito todas las puertas lógicas de dos entradas posibles, incluidas las funciones XOR y EQUALS.
  • Demostró respuestas robustas y fuertes con cambios de 5 a >300 veces entre estados.
  • Las moléculas de detección de quórum sirvieron efectivamente como cables de comunicación entre las puertas diseñadas.

Conclusiones:

  • Puertas de lógica genética simples se pueden combinar para realizar cálculos complejos en el espacio.
  • Recablear la comunicación célula-célula es una estrategia viable para diseñar diversos cálculos biológicos.
  • Este trabajo proporciona principios de diseño para aprovechar la computación celular en biología sintética.