Los puntos calientes de la reprogramación epigenómica aberrante en las células madre pluripotentes inducidas por...

Área de la Ciencia:

• La epigenética es la epigenética.
• Biología de las células madre Biología de las células madre
• La genómica es la genómica.

Sus antecedentes:

• Las células madre pluripotentes inducidas (iPSC) se generan mediante la reprogramación de las células somáticas, con el objetivo de imitar las células madre embrionarias (ES) para la medicina regenerativa.
• La reconfiguración epigenómica es clave para este proceso, pero la integridad de la restauración del patrón de metilación del ADN sigue sin estar clara.

Objetivo del estudio:

• Analizar exhaustivamente los patrones de metilación del ADN de todo el genoma en las células iPSC humanas en comparación con las células ES y las células somáticas.
• Investigar el alcance del restablecimiento de la metilación del ADN similar a las células ES e identificar posibles errores de reprogramación.

Principales métodos:

• Se realizó un perfil de metilación de ADN de genoma completo con resolución de una sola base en cinco líneas iPSC humanas.
• Se analizaron los metilomas de las células ES emparejadas, las células somáticas y las células iPSC / ES diferenciadas para su comparación.

Principales resultados:

• Las iPSC humanas exhiben una significativa variabilidad de reprogramación, incluida la retención de la "memoria somática" y la metilación aberrante del ADN.
• Las regiones diferencialmente metiladas compartidas a escala de megabases cerca de los centrómeros y los telómeros indican una reprogramación incompleta de la metilación no-CG.
• Se observaron diferencias en la metilación CG y las modificaciones histónicas entre las células iPSC y las células ES.

Conclusiones:

• La reprogramación de la variabilidad en las iPSC lleva a una restauración incompleta de los patrones de metilación del ADN de las células ES.
• Los errores en la reprogramación de la metilación CG se transmiten con frecuencia durante la diferenciación, estableciendo una firma de reprogramación iPSC persistente.