La genómica de una sola célula revela las interacciones entre organismos en protistas marinos no cultivados

Área de la Ciencia:

• Microbiología marina microbiología marina.
• La genómica es la genómica.
• Virología Virología.

Sus antecedentes:

• Las picobilifitas son un filo recientemente descrito de fitoplancton marino.
• Estudios anteriores sugirieron que poseen plástidos para la fotosíntesis.

Objetivo del estudio:

• Para investigar el contenido genómico y las interacciones ecológicas de picobilifitas marinas no cultivadas.
• Para determinar las capacidades metabólicas y las asociaciones virales de las células picobilifitas individuales.

Principales métodos:

• Secuenciación de escopeta de genoma completo de ADN de tres células picobilifitas individuales.
• Análisis de ADN ribosomal para determinar la ubicación filogenética.
• Análisis bioinformático para identificar secuencias virales y bacterianas de ADN.

Principales resultados:

• Las tres células representaban clados divergentes de picobilifitas.
• No se encontró evidencia de ADN plástico o proteínas dirigidas a plásticos, lo que sugiere una nutrición heterotrófica.
• El genoma de una célula estaba dominado por secuencias de virus de ADN de una sola cadena.
• Las otras dos células contenían ADN de Bacteroidetes marinos y grandes virus de ADN.

Conclusiones:

• Los picobilifitos marinos pueden ser predominantemente heterotróficos, lo que desafía las suposiciones anteriores.
• Las células picobilifitas individuales exhiben distintas interacciones con virus y bacterias.
• La secuenciación de escopeta de células no cultivadas proporciona información sobre la diversidad microbiana y las funciones ecológicas.