La repetición heptad en la subunidad más grande de la ARN polimerasa II se une por intercalación en el ADN

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• La bioquímica es la bioquímica.
• Genética La genética.

Sus antecedentes:

• La subunidad más grande de la ARN polimerasa II contiene una repetición en tándem C-terminal (Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser-Tyr).
• Esta repetición es esencial para la función normal de la polimerasa, con 11-23 unidades requeridas.
• El papel funcional preciso de esta repetición, particularmente su interacción propuesta con los factores de transcripción, sigue sin estar claro.

Objetivo del estudio:

• Para investigar el papel funcional de la repetición C-terminal en la ARN polimerasa II.
• Para determinar si la secuencia de repetición se une directamente con el ADN.
• Para dilucidar el mecanismo por el cual la repetición interactúa con el ADN.

Principales métodos:

• Experimentos con péptidos sintéticos que contienen una o dos unidades de repetición.
• Modelado estructural que compara la estructura de giro beta de la unidad de repetición con las drogas de intercalación de ADN.
• Comparación con la conocida estructura de unión al ADN de Triostin A.

Principales resultados:

• Se demostró que la secuencia de repetición C-terminal se une al ADN.
• La evidencia sugiere que la unión al ADN ocurre a través de la intercalación de los residuos de tirosina.
• Un modelo estructural indica una superposición entre las cadenas laterales de tirosina y los anillos de quinoxalina intercalados en el ADN de Triostin A.

Conclusiones:

• La repetición C-terminal de la ARN polimerasa II se une directamente con el ADN.
• La unión al ADN está mediada por la intercalación de residuos de tirosina dentro de la secuencia de repetición.
• Las similitudes estructurales con los intercaladores de ADN conocidos apoyan este mecanismo de unión.