Especificidad de los nucleosomas en todo el genoma y direccionalidad de los remodeladores de cromatina

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• Genética La genética.
• Biología de la cromatina Biología de la cromatina

Sus antecedentes:

• La organización de los nucleosomas es crucial para la regulación de los genes.
• Los mecanismos cooperativos de los remodeladores de cromatina en la organización de los nucleosomas en los extremos de los genes siguen siendo en gran medida desconocidos.
• Comprender la función del remodelador es clave para descifrar la accesibilidad del genoma.

Objetivo del estudio:

• Para determinar los patrones de unión en todo el genoma de múltiples complejos remodeladores de cromatina.
• Aclarar las funciones funcionales de estos remodeladores en el posicionamiento del nucleosoma en las regiones reguladoras de genes.
• Para investigar la organización subnucleosómica del complejo remodelador Isw2.

Principales métodos:

• Mapeo de todo el genoma de los complejos remodeladores (SWI / SNF, RSC, ISW1a, ISW1b, ISW2, INO80) utilizando ChIP-exo.exo de ultra alta resolución.
• Análisis de eliminación para evaluar la contribución funcional de los remodeladores al posicionamiento del nucleosoma.
• Modelado bioquímico y cristalográfico para comprender la organización subnucleosómica Isw2.

Principales resultados:

• Complejos remodeladores específicos se unen a posiciones nucleosómicas definidas en los extremos 5' y 3' de los genes.
• Los remodeladores exhiben direccionalidad, moviendo los nucleosomas lejos de o hacia regiones libres de nucleosomas.
• El complejo Isw2 muestra una organización subnucleosómica consistente con los modelos que lo colocan en regiones promotoras.

Conclusiones:

• Los remodeladores de cromatina cooperan de una manera específica de posición para organizar los nucleosomas genéticos.
• Esta acción coordinada establece matrices de nucleosomas esenciales para la regulación génica.
• Los hallazgos proporcionan un marco para comprender cómo los remodeladores establecen paisajes de cromatina.