El interactoma EJC celular revela una estructura mRNP de orden superior y un nexo de proteínas EJC-SR

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• ARN Biología Biología ARN
• Expresión génica de la expresión génica.

Sus antecedentes:

• El empalme del pre-ARNm da forma a las transcripciones eucarióticas e influye en la composición de la ribonucleoproteína mensajera (mRNP).
• El complejo de unión de exones (EJC) se deposita en mRNA empalmados en las uniones exón-exón y es un componente clave de los mRNP.

Objetivo del estudio:

• Para analizar exhaustivamente la proteína endógena humana EJC y los interactomas de ARN.
• Investigar la ocupación in vivo y las interacciones del EJC.

Principales métodos:

• Análisis de la proteína EJC humana endógena y los interactomas de ARN.
• Confirmación de los sitios de ocupación de EJC y la prevalencia en las uniones de exones.

Principales resultados:

• El sitio canónico del EJC está confirmado 24 nucleótidos aguas arriba de las uniones de exones, con la mayoría de las uniones de exones que llevan un EJC.
• Las EJC endógenas multimerizan entre sí y con numerosas proteínas SR, formando grandes complejos.
• Las proteínas SR son super-equiquiométricas a los factores centrales del EJC dentro de estos complejos.

Conclusiones:

• La asociación física entre los EJC y las proteínas SR probablemente explica sus paralelismos funcionales.
• Las EJC y las proteínas SR cooperan para proteger el ARNm de la digestión de la nucleasa, promoviendo el empaquetado y la compactación del ARNm.