Los ARN activadores se asocian con el mediador para mejorar la arquitectura de la cromatina y la transcripción

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología Molecular Biología Molecular
• La epigenética es la epigenética.

Sus antecedentes:

• La investigación genómica revela numerosas transcripciones no codificantes de proteínas, incluidos los ARN largos no codificantes (ARNlnc).
• Si bien los lncRNAs son conocidos por sus funciones epigenéticas como la inactivación del cromosoma X, sus diversas funciones están bajo investigación.
• Una clase específica, el activador de ncRNA (ncRNA-a), activa los genes vecinos a través de un mecanismo mediado por cis.

Objetivo del estudio:

• Para aclarar el mecanismo preciso de la función de ncRNA-a similar al potenciador.
• Determinar el papel de los componentes del complejo de coactivadores de transcripción en la activación de genes dependientes del ncRNA.
• Investigar la interacción entre el ncRNA-a y el complejo mediador en la regulación génica.

Principales métodos:

• El agotamiento de los factores de activación transcripcional conocidos en las células humanas HEK293.
• Los ensayos de reporter heterólogo evalúan la activación transcripcional dependiente del ARN.
• Estudios in vivo que involucran el reclutamiento de mediadores, la localización de la cromatina y ensayos de actividad de la quinasa.
• Captura de la conformación cromosómica para analizar el bucle de ADN entre los loci ncRNA-a y los genes diana.

Principales resultados:

• El agotamiento de los componentes del complejo Mediator redujo significativamente la transcripción inducida por el ncRNA-a.
• El complejo mediador es reclutado para los genes diana ncRNA-a in vivo, regulando su expresión.
• ncRNA-a interactúa con el Mediador, influyendo en su localización de la cromatina y la actividad de la histona H3 serina 10 quinasa.
• El complejo Mediador asociado con la enfermedad muestra una interacción reducida con la activación de los ncRNAs.
• El agotamiento del mediador o el ncRNA-a interrumpió el bucle de ADN entre los loci del ncRNA-a y los genes diana.

Conclusiones:

• El complejo Mediador humano actúa como un transductor para activar los ncRNA.
• La asociación entre el mediador y los ncRNAs activadores es crítica para la regulación génica.
• Mediador deteriorado y la activación de la interacción de ncRNA está implicada en enfermedades humanas.