Una máquina de degradación de ARN esculpida por el autoantígeno Ro y el ARN no codificante

Área de la Ciencia:

• Bacteriología Bacteriología.
• Biología Molecular Biología Molecular
• ARN Biología Biología ARN

Sus antecedentes:

• Muchas bacterias poseen un ortólogo de autoantígeno Ro que se une a los ARNs Y.
• En Deinococcus radiodurans, el ortólogo Ro Rsr está involucrado en el procesamiento y descomposición del ARNr.
• El mecanismo exacto de la función de Rsr y Y ARN no estaba claro.

Objetivo del estudio:

• Para dilucidar el mecanismo de Ro ortholog Rsr y Y ARN en el procesamiento de ARN bacteriano.
• Para caracterizar el complejo de ribonucleoproteínas formado por Rsr, Y RNA y PNPase.
• Investigar el papel del ncRNA en la alteración de la especificidad del sustrato de la enzima.

Principales métodos:

• Microscopía electrónica de una sola partícula para determinar la estructura compleja.
• El modelo atómico acoplado a las reconstrucciones de microscopía electrónica.
• Pruebas bioquímicas para evaluar la actividad de degradación del ARN.

Principales resultados:

• Rsr y la fosforilasa de polinucleótido (PNPase) forman una máquina de degradación de ARN basado en Y. ARN.
• Rsr facilita la canalización del ARN monocatenario en el sitio activo de la PNPasa.
• El Rsr y el ARNY permiten a la PNPasa degradar eficazmente los ARN estructurados.
• Se observó un complejo similar que involucra a un ortólogo Ro, ncRNA y PNPase en Salmonella Typhimurium.

Conclusiones:

• Se identificó una nueva máquina de ribonucleoproteína bacteriana para la degradación del ARN.
• Se demostró que el ncRNA puede modificar la especificidad del sustrato de la enzima mediante la unión de cofactores de proteínas.
• Reveló un mecanismo conservado para el procesamiento y la degradación del ARN en todas las especies bacterianas.