La estabilización del bucle R reprime la transcripción antisenso en el locus de Arabidopsis FLC

Área de la Ciencia:

• Biología Molecular Biología Molecular
• Genética vegetal Genética vegetal
• La epigenética es la epigenética.

Sus antecedentes:

• Los ARN largos no codificantes (ARNlnc) juegan un papel en la expresión génica, pero su propia regulación no se entiende bien.
• La regulación de las transcripciones antisense, como COOLAIR originado en el locus Arabidopsis FLOWERING LOCUS C (FLC), sigue siendo en gran parte inexplorada.

Objetivo del estudio:

• Para identificar los factores reguladores que controlan la expresión del lncRNA.
• Investigar el mecanismo por el cual la proteína del homeodominio AtNDX regula la transcripción COOLAIR.

Principales métodos:

• Pruebas de unión al ADN in vitro para caracterizar la interacción de AtNDX con el ADN.
• Estudios de localización in vivo de AtNDX dentro del genoma de la Arabidopsis.
• Detección de híbridos de ARN-ADN (bucles R) en el promotor COOLAIR.
• Análisis de la expresión génica FLC en respuesta a la estabilización del bucle R mediada por AtNDX.

Principales resultados:

• Se identificó la proteína del homeodominio AtNDX como un regulador del lncRNA COOLAIR.
• AtNDX se une al ADN monocatenario y se localiza en la región heterocromática del promotor COOLAIR.
• In vivo, AtNDX estabiliza los bucles R, que son híbridos de ARN-ADN que cubren el promotor COOLAIR.
• La estabilización de los bucles R por AtNDX inhibe la transcripción COOLAIR, afectando posteriormente la expresión de FLC.

Conclusiones:

• La estabilización del bucle R mediada por AtNDX es un nuevo mecanismo para regular la transcripción del lncRNA.
• Esta vía reguladora influye en la expresión del gen FLC en Arabidopsis.
• La estabilización diferencial del bucle R puede representar un mecanismo general para controlar la expresión génica en varios organismos.