Variación y control genético de la abundancia de proteínas en humanos

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• La proteómica es la proteómica.
• Genética humana Genética humana es la genética humana.

Sus antecedentes:

• La variación de la expresión génica contribuye a las diferencias fenotípicas.
• Comprensión limitada de la variación de la abundancia de proteínas humanas y sus fundamentos genéticos.
• Los niveles de ARN mensajero son predictores imperfectos de los niveles de proteínas debido a la regulación post-transcripcional.

Objetivo del estudio:

• Para cuantificar los niveles relativos de proteínas en diversos individuos humanos.
• Para investigar la heredabilidad y la variación de la abundancia de proteínas.
• Para identificar las variantes genéticas (cis-pQTLs) que influyen en los niveles de proteínas.

Principales métodos:

• Espectrometría de masas cuantitativa (basada en etiquetas isobáricas) utilizada para la cuantificación de proteínas.
• Análisis de líneas celulares linfoblastoides de 95 individuos del proyecto HapMap.
• Integración de datos proteómicos con la variación del ADN y la información del transcriptoma.

Principales resultados:

• Los niveles de proteínas son fenotipos moleculares hereditarios con variaciones significativas entre individuos, entre poblaciones y basadas en el sexo.
• Co-variación observada en los niveles de proteínas para conjuntos de proteínas dentro de las mismas vías biológicas.
• Identificación de cis-pQTLs, incluidas las variantes omitidas por estudios previos del transcriptoma.

Conclusiones:

• La cuantificación del proteoma humano de alto rendimiento es factible.
• La variación de la abundancia de proteínas proporciona información sobre la regulación de la expresión génica más allá de los niveles de ARNm.
• La integración de datos proteómicos, de variación del ADN y de transcriptoma ofrece una visión completa de los fenotipos moleculares.