La direccionalidad del promotor está controlada por las señales U1 snRNP y de poliadenilación

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología Molecular Biología Molecular
• Reglamento genético Reglamento genético.

Sus antecedentes:

• La transcripción del genoma de los mamíferos es generalizada, pero la transcripción productiva está restringida por mecanismos desconocidos.
• La ARN polimerasa II (RNAPII) inicia de manera divergente de la mayoría de los promotores, sin embargo, la elongación se produce principalmente en la dirección de la codificación sensorial.

Objetivo del estudio:

• Investigar los mecanismos que controlan la direccionalidad del promotor y la transcripción productiva.
• Para identificar los determinantes de la secuencia que regulan la escisión promotor-proximal y la poliadenilación.

Principales métodos:

• Análisis de células madre embrionarias de ratón.
• Análisis de motivos de novo de los determinantes de la secuencia que flanquean los sitios de inicio de la transcripción.
• Interrupción funcional de la actividad de la U1 pequeña ribonucleoproteína nuclear (snRNP).

Principales resultados:

• Los determinantes asimétricos de la secuencia regulan la direccionalidad del promotor a través de la escisión promotor-próxima y la poliadenilación.
• Los ARN antisentido aguas arriba son escindidos y poliadenilados poco después de la iniciación.
• Los sitios de reconocimiento de U1 snRNP y las señales del sitio poli (PAS) se distribuyen diferencialmente en direcciones de sentido y antisenso y evolucionan con el tiempo.
• La interrupción de la actividad de la U1 snRNP aumenta los eventos de escisión proximal del promotor.

Conclusiones:

• Un eje U1-PAS refuerza la direccionalidad del promotor al promover la terminación temprana de la transcripción antisentido aguas arriba.
• Este eje limita la transcripción generalizada en todo el genoma al suprimir las señales PAS del sentido proximal a través de U1 snRNP.
• Los hallazgos revelan un nuevo mecanismo regulador para controlar la transcripción de todo el genoma.