Descubrimiento guiado por la estructura de nuevas enzimas desaminasas

Área de la Ciencia:

• Enzimología genómica enzimología genómica.
• La bioquímica de las proteínas.
• Biología estructural Biología estructural.

Sus antecedentes:

• La anotación confiable de proteínas con funciones desconocidas presenta un desafío significativo en la enzimología genómica.
• La superfamilia de amidohidrolasas contiene numerosas enzimas con funciones no caracterizadas.
• Trabajos previos identificaron a Tm0936 como una enzima que desamina la S-adenosilhomocisteína (SAH).

Objetivo del estudio:

• Para interrogar enzimas no caracterizadas de la superfamilia de amidohidrolasas utilizando un enfoque guiado por la estructura.
• Para identificar nuevas actividades enzimáticas y especificidades de sustratos dentro de esta familia de proteínas.
• Para mejorar la anotación funcional de proteínas de función desconocida.

Principales métodos:

• Integración de la bioinformática, la biología computacional y la enzimología molecular.
• Análisis guiado por la estructura, incluyendo acoplamiento molecular y cristalografía de rayos X.
• Purificación y ensayos enzimáticos de quince proteínas candidatas.

Principales resultados:

• Se han identificado subgrupos de enzimas capaces de desaminar varios análogos de la adenosina (SAH, MTA, Ado, 5'-dAdo).
• Descubrió la primera enzima (Dvu1825) capaz de desaminar la 5'-deoxyadenosina (5'-dAdo).
• Enzimas caracterizadas con nuevas actividades, incluida la desaminación de la guanina y la desaminación de las formas oxidadas de adenina (2-oxoadenina, 8-oxoadenina).

Conclusiones:

• Un enfoque multidisciplinario guiado por la estructura es efectivo para anotar enzimas de función desconocida.
• El estudio amplía el repertorio funcional conocido de la superfamilia de amidohidrolasas.
• Perfiles de sustrato propuestos para 834 secuencias de proteínas, mejorando la anotación genómica.