Las secuencias aguas arriba modulan el promotor interno del gen ARN 7SL humano

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología Molecular Biología Molecular
• ARN Biología Biología ARN

Sus antecedentes:

• El genoma humano contiene numerosas secuencias relacionadas con el ARN 7SL, incluyendo genes 7SL, pseudogenes y abundantes secuencias Alu.
• Tanto los genes 7SL como los elementos Alu son transcritos por la ARN polimerasa III, pero sus niveles de expresión difieren significativamente.

Objetivo del estudio:

• Investigar las razones detrás de la eficiencia diferencial de transcripción de los genes 7SL y los elementos Alu por la ARN polimerasa III.
• Identificar los elementos reguladores responsables de la transcripción eficiente de los genes 7SL.

Principales métodos:

• Ensayos de transcripción in vitro utilizando un gen humano 7SL, secuencias sintéticas de Alu, elementos Alu representativos y pseudogenes 7SL.
• Construcción y prueba de mutantes 5' de eliminación e inserción del gen 7SL para identificar regiones reguladoras esenciales.

Principales resultados:

• Un gen humano 7SL y un derivado sintético de Alu se expresaron 50-100 veces más eficientemente in vitro que los elementos Alu representativos o los pseudogenes 7SL.
• Los primeros 37 nucleótidos aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción, junto con el promotor interno, son esenciales para la iniciación eficiente y precisa de la transcripción del gen 7SL in vitro.

Conclusiones:

• La transcripción limitada de la mayoría de los elementos Alu y los seudógenos 7SL in vivo se debe probablemente a la ausencia del elemento regulador upstream esencial que se encuentra en los genes 7SL.
• Este elemento regulador puede contribuir a la homogeneidad de las familias Alu dentro de los genomas de los mamíferos y las diferencias específicas de las especies.