Los mapas interactómicos de los dominios reguladores de los genes de ratón revelan los principios básicos de la...

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología del desarrollo Biología del desarrollo.
• La epigenética es la epigenética.

Sus antecedentes:

• El uso de potenciadores en las células de mamíferos cambia durante el desarrollo.
• La naturaleza precisa y el alcance de estas alteraciones del potenciador no se entienden completamente.

Objetivo del estudio:

• Mapear las interacciones promotor-potenciador en células ES pluripotentes y linfocitos B diferenciados.
• Para investigar la naturaleza dinámica del paisaje potenciador a través de diferentes tipos de células.

Principales métodos:

• Tecnologías combinadas de hipersensibilidad DNaseI, ChIP-seq y ChIA-PET.
• Utilizó metilomas CpG de alta resolución, edición del genoma y huellas digitales.

Principales resultados:

• Se confirmó una variación significativa en el uso de potenciadores en todos los tejidos, incluso para genes ampliamente transcritos como Myc y Pim1.
• Se demostró que los potenciadores se asocian con diferentes conjuntos de factores reguladores en las células ES y B.
• Se mostró una correlación entre la actividad potenciadora, la actividad promotora y el reclutamiento de factores determinantes del linaje durante el desarrollo.

Conclusiones:

• Los organismos dependen de un paisaje dinámico de potenciadores para el control específico del tejido de las funciones celulares fundamentales.
• La reprogramación del potenciador juega un papel crucial en la diferenciación y el desarrollo celular.