La secuenciación de ARN de una sola célula revela una expresión génica dinámica y aleatoria monoalélica en células de...

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• Biología del desarrollo Biología del desarrollo.
• La epigenética es la epigenética.

Sus antecedentes:

• Las células diploides típicamente muestran expresión de ambos alelos del gen.
• Los patrones de expresión alélica de todo el genoma en células individuales siguen sin caracterizarse en gran medida.

Objetivo del estudio:

• Para investigar los patrones de expresión alélica de todo el genoma en células embrionarias individuales de ratón.
• Para determinar la prevalencia y la dinámica de la expresión génica monoalélica.

Principales métodos:

• Análisis unicelular de embriones de preimplantación de ratón de origen genético mixto (CAST/EiJ × C57BL/6J).
• Evaluación global de la expresión alélica de los cromosomas autosómicos y X.

Principales resultados:

• Se observó una expresión monoalélica abundante (12-24%) para los genes autosómicos.
• Se encontró que la expresión alélica era independiente, aleatoria y dinámica entre células estrechamente relacionadas.
• Se demostró la inactivación de novo del cromosoma X paterno.
• Se detectaron patrones de expresión monoalélica similares en células maduras.

Conclusiones:

• La transcripción alélica independiente y estocástica impulsa una abundante expresión aleatoria monoalélica en las células de mamíferos.
• La expresión alélica es un proceso dinámico que varía significativamente incluso entre las células vecinas.