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Translational Regulation01:29

Translational Regulation

877
Translational regulation in prokaryotes ensures efficient protein synthesis by controlling ribosome access to mRNA. This regulation is mediated by secondary RNA structures, including translational riboswitches, RNA thermometers, and small RNAs (sRNAs), which respond to intracellular and environmental signals to modulate gene expression.Translational RiboswitchesRiboswitches in the leader region of mRNAs can regulate translation by altering the accessibility of the Shine-Dalgarno (SD) sequence,...
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El perfil de la cola poli-A revela un cambio embrionario en el control traslacional.

Alexander O Subtelny1, Stephen W Eichhorn2, Grace R Chen3

  • 11] Howard Hughes Medical Institute, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, Massachusetts 02139, USA [2] Whitehead Institute for Biomedical Research, 9 Cambridge Center, Cambridge, Massachusetts 02142, USA [3] Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, Massachusetts 02139, USA [4] Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology, Cambridge, Massachusetts 02139, USA [5].

Nature
|January 31, 2014
PubMed
Resumen

El perfil de longitud de cola poli-A por secuenciación (PAL-seq) mide las longitudes de cola de ARN en todas las especies. Esto revela longitudes de cola conservadas y un cambio de desarrollo en el control traslacional durante la embriogénesis.

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Área de la Ciencia:

  • Biología Molecular Biología Molecular
  • La genómica es la genómica.
  • Biología del desarrollo Biología del desarrollo.

Sus antecedentes:

  • La poliadenilación es crucial para la estabilidad y la traducción del ARN mensajero eucariota (ARNm).
  • La medición global de las longitudes de las colas poli-A ha sido técnicamente difícil, lo que limita la comprensión de su función.

Objetivo del estudio:

  • Desarrollar y aplicar un método de alto rendimiento para la medición de la longitud de la cola poli-A en diversas especies.
  • Investigar la relación entre la longitud de la cola poli-A, la estabilidad del ARNm y la eficiencia de traducción durante el desarrollo.

Principales métodos:

  • Se desarrolló el perfil de longitud de cola poli-A por secuenciación (PAL-seq) para cuantificar las longitudes individuales de cola poli-A de ARN.
  • PAL-seq se aplicó a millones de ARN de varios organismos, incluidas levaduras, líneas celulares, Arabidopsis, ratones, peces cebra y ranas.

Principales resultados:

  • Las longitudes de la cola poli-A se conservaron a través de ARNm ortólogos en diferentes especies.
  • Los ARNm que codifican las proteínas ribosomales y los genes de limpieza generalmente exhiben colas poli (A) más cortas.
  • Se observó un fuerte acoplamiento entre la longitud de la cola poli-A y la eficiencia traslacional en los primeros embriones de pez cebra y rana, que disminuyeron durante la gastrulación.

Conclusiones:

  • El estudio identificó patrones conservados de la longitud de la cola poli-A y reveló un cambio significativo en el desarrollo en el control traslacional.
  • Este cambio en la regulación traslacional complementa la transición al control transcripcional cigótico y explica los efectos de dedenilación mediados por microARN.