Interpretación clínica e implicaciones de la secuenciación del genoma completo

Área de la Ciencia:

• La genómica es la genómica.
• La medicina clínica es la medicina clínica.
• La bioinformática es la bioinformática.

Sus antecedentes:

• La secuenciación del genoma completo (WGS) se utiliza cada vez más en entornos clínicos.
• Se espera que WGS identifique hallazgos genéticos clínicamente significativos independientemente de la razón de la secuenciación.

Objetivo del estudio:

• Evaluar la cobertura y la concordancia de las variaciones genéticas clínicamente relevantes de WGS.
• Para cuantificar el riesgo de enfermedades hereditarias y los hallazgos farmacogenómicos en los datos de WGS.
• Evaluar las acciones clínicas impulsadas por los hallazgos de la WGS.

Principales métodos:

• Estudio exploratorio de 12 participantes adultos sometidos a WGS.
• Un equipo multidisciplinario revisó los hallazgos genéticos.
• Los médicos propusieron un seguimiento clínico basado en los resultados de la WGS.

Principales resultados:

• El 10-19% de los genes de enfermedades hereditarias tenían una cobertura inadecuada para el descubrimiento de variantes.
• La concordancia genotípica fue alta para las variantes de un solo nucleótido (99-100%) pero baja para las pequeñas variantes de inserción / eliminación (53-59%).
• Descubrimiento de 2-6 hallazgos de riesgo de enfermedad por participante, incluida una variante de BRCA1; se consideró el seguimiento clínico para 1-3 pruebas/referencias por participante.

Conclusiones:

• El WGS demostró una cobertura incompleta de los genes de enfermedades hereditarias y una baja reproducibilidad para las variantes de alto impacto.
• Existe incertidumbre con respecto a los hallazgos clínicamente reportables de WGS.
• WGS puede identificar variantes procesables, pero su papel clínico requiere una cuidadosa consideración de las limitaciones actuales.