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Asociación de la identidad del aceptador de ARN de transferencia con una irregularidad helicoidal
W H McClain1, Y M Chen, K Foss
1Department of Bacteriology, University of Wisconsin, Madison 53706.
Resumen
El par de oscilación G.U en la hélice del aceptador de ARN de transferencia (ARNt) influye en la especificidad de la aminoacilación, no por su secuencia sino por inducir irregularidades estructurales que coinciden con la enzima aminoaciladora.
Área de la Ciencia:
- Biología Molecular Biología Molecular
- La bioquímica es la bioquímica.
- Biología Estructural Biología estructural.
Sus antecedentes:
- La especificidad de la aminoacilación del ARN de transferencia (ARNt), o la identidad del aceptador, se ha relacionado con las posiciones de los nucleótidos en lugar de los elementos estructurales 3D.
- El papel de pares de bases específicos, como el par de oscilación de G.U en la hélice aceptora, en la determinación de la identidad del tRNA no se entiende completamente.
Objetivo del estudio:
- Investigar la contribución de un par de oscilaciones de G.U en la hélice aceptora del tRNA (Ala) a su identidad aceptora.
- Para determinar si los emparejamientos específicos de nucleótidos o las características estructurales inducidas por el par de oscilación G.U son responsables de la identidad del aceptor.
Principales métodos:
- Se utilizaron tRNAs supresores sintéticos de ámbar en Escherichia coli.
- Sustituye sistemáticamente el par de oscilación G.U en tRNA ((Ala) con otros pares de oscilación (G.A, C.A, U.U).
- Translocó el par de oscilación de G.U a un sitio diferente dentro de la hélice aceptora del tRNA (((Ala).
- Identidad de aceptor evaluada de las construcciones modificadas de tRNA (Ala) y tRNA (Lys).
Principales resultados:
- La sustitución del par de oscilación de G.U por G.A, C.A o U.U no afectó la identidad del aceptador de tRNA (((Ala).
- La transferencia del par de oscilación G.U al tRNA (Lys) confirió al tRNA (Ala) la identidad del aceptador.
- Trasladar el par de oscilación G.U a otro sitio en la hélice del aceptador mantuvo una identidad aceptor sustancial.
Conclusiones:
- La contribución del par de oscilación G.U. a la identidad del aceptador es estructural, no dependiente de la secuencia.
- Es probable que este par de oscilaciones induzca una irregularidad en la hélice del aceptador de tRNA.
- Esta irregularidad facilita el reconocimiento y la unión por la enzima aminoaciladora específica.