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Updated: Apr 29, 2026
Comprehensive Workflow of Mass Spectrometry-based Shotgun Proteomics of Tissue Samples
Published on: November 13, 2021
Proyecto del proteoma humano basado en la espectrometría de masas
Mathias Wilhelm1, Judith Schlegl2, Hannes Hahne3
11] Chair of Proteomics and Bioanalytics, Technische Universität München, Emil-Erlenmeyer Forum 5, 85354 Freising, Germany [2] SAP AG, Dietmar-Hopp-Allee 16, 69190 Walldorf, Germany [3].
Este estudio presenta un borrador del proteoma humano basado en la espectrometría de masas y ProteomicsDB, una base de datos para analizar grandes conjuntos de datos proteómicos. Ofrece información sobre proteínas específicas de órganos, ARN no codificantes intergenicos traducidos largos y predicciones de sensibilidad a medicamentos.
Área de la Ciencia:
- La proteómica es la proteómica.
- La bioinformática es la bioinformática.
- La genómica es la genómica.
Sus antecedentes:
- Los proteomas contienen información biológica vital, incluida la abundancia de proteínas, patrones de expresión y modificaciones, inaccesibles a través de la genómica o la transcriptómica.
- Comprender el proteoma humano es crucial para avanzar en los conocimientos biológicos y desarrollar nuevas tecnologías.
Objetivo del estudio:
- Para crear un borrador basado en la espectrometría de masas del proteoma humano.
- Desarrollar ProteomicsDB, una base de datos pública de alto rendimiento para el análisis en tiempo real de datos proteómicos a gran escala.
- Para identificar proteínas específicas de órganos, RNAs no codificantes intergenicos largos traducidos (lincRNAs) y proteínas asociadas con la sensibilidad a los medicamentos.
Principales métodos:
- Proteómica basada en la espectrometría de masas para generar un borrador del proteoma humano.
- Desarrollo de ProteomicsDB, una base de datos en memoria para el manejo de terabytes de datos proteómicos.
- Integración de datos proteómicos con perfiles de expresión de ARN mensajero y datos de sensibilidad a fármacos.
Principales resultados:
- Se estableció un proyecto exhaustivo del proteoma humano.
- Se creó ProteomicsDB, que permite el análisis en tiempo real de grandes conjuntos de datos proteómicos.
- Identificación de proteínas específicas de órganos, numerosos lincRNA traducidos y proteínas que predicen la resistencia o sensibilidad a los medicamentos.
- El análisis reveló un control conservado de la abundancia de proteínas en los tejidos humanos.
Conclusiones:
- El Proyecto del Proteoma Humano y ProteomicsDB proporcionan valiosos recursos para la investigación biológica.
- Estos recursos facilitan la navegación de los proteomas, ofrecen conocimientos biológicos y apoyan el avance de las tecnologías proteómicas.
- Los hallazgos tienen implicaciones para la comprensión de la expresión génica, la estequiometría del complejo proteico y la medicina personalizada a través de la predicción de la sensibilidad a los medicamentos.
