Análisis comparativo de la información reguladora y los circuitos entre especies distantes

Área de la Ciencia:

• La genómica comparada es una genómica comparada.
• Biología molecular La biología molecular.
• Biología evolutiva Biología evolutiva.

Sus antecedentes:

• Las especies de metazoos exhiben similitudes biológicas a pesar de las distancias evolutivas, estableciendo organismos modelo como moscas y gusanos para la investigación de la biología humana.
• Estudios anteriores exploraron similitudes en la regulación génica, pero faltaba un análisis comparativo a gran escala de las características reguladoras de la transcripción.

Objetivo del estudio:

• Realizar un análisis comparativo a gran escala de las ubicaciones de unión de todo el genoma para los factores reguladores de la transcripción en humanos, moscas y gusanos.
• Identificar los principios conservados en las características reguladoras de la transcripción y las redes reguladoras de genes.

Principales métodos:

• Mapeo de todo el genoma de los sitios de unión del factor regulador de la transcripción para 165 factores humanos, 93 de gusanos y 52 de moscas.
• Generación de 1.019 conjuntos de datos de diversos tipos celulares, etapas de desarrollo y condiciones.
• Análisis de los motivos vinculantes y las co-asociaciones de las familias de factores reguladores ortólogos.

Principales resultados:

• Las propiedades estructurales de las redes reguladoras se conservan notablemente en todas las especies estudiadas.
• Las familias de factores reguladores ortólogos reconocen motivos de unión similares in vivo.
• Se observó evidencia de coasociaciones conservadas entre los factores reguladores.

Conclusiones:

• Las propiedades reguladoras de los genes son principios generales de la regulación de los metazoos, bien conservados a pesar de la divergencia funcional.
• Los mapas comparativos de los circuitos reguladores mejoran la comprensión de la biología del organismo modelo y su relación con la biología humana, el desarrollo y la enfermedad.